Conformational Analysis of a Cyclic Heptapeptide, Pseudostellarin D by Molecular Dynamics and Monte Carlo Simulations
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概要
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Restrained molecular dynamics calculation in vacuo using AMBER force field implemented in MacroModel/Batchmin showed a major solution conformation in dimethyl sulfoxide-d_6 of pseudostellarin D, cyclo(-Gly-Tyr-Gly-Pro-Leu-Ile-Leu-). This is a cyclic heptapeptide isolated from Pseudostellaria heterophylla possessing characteristics of a β-bulge motif with three intramolecular hydrogen bonds, two β-turns (one type I at Pro^4 and Leu^5 residues, and one type II at Leu^7 and Gly^1 residues) and all trans amide bonds. The solution form of pseudostellarin D, which was homologous to that observed in the solid state, was also supported by Monte Carlo simulation study.
- 社団法人日本薬学会の論文
- 1996-11-15
著者
-
森田 浩
大阪大学 大学院 情報科学研究科
-
糸川 秀治
東京薬大
-
森田 博史
Department Of Pharmacognosy School Of Pharmacy Tokyo University Of Pharmacy And Life Sciences
-
竹谷 孝一
東京都立衛生研究所
-
糸川 秀治
東京都立衛生研究所
-
Morita Hiroshi
Department of Cardiology, Shingu Munichipal Hospital
-
竹谷 孝一
東京薬大薬
-
森田 肇
Research Laboratories Toyama Chemical Co. Ltd.
-
糸川 秀治
東京薬科大学 薬学部
-
Takeya Koichi
Department Of Pharmacognosy Tokyo College Of Pharmacy
-
ITOKAWA Hideji
Department of Pharmacognosy, School of Pharmacy, Tokyo University of Pharmacy and Life Sciences
-
KAYASHITA Takashi
Department of Pharmacognosy, School of Pharmacy, Tokyo University of Pharmacy and Life Science
-
Itokawa H
Department Of Pharmacognosy School Of Pharmacy Tokyo University Of Pharmacy And Life Sciences
-
Itokawa Hideji
Department Of Pharmacognosy Tokyo College Of Pharmacy
-
Takeya Koichi
Department Of Pharmacognosy School Of Pharmacy Tokyo University Of Pharmacy And Life Science
-
Kayashita Takashi
Department Of Pharmacognosy School Of Pharmacy Tokyo University Of Pharmacy And Life Science
-
Morita Hiroshi
Department Of Applied Chemistry School Of Engineering Kanagawa University
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