RFHR 2-D PAGE 装置の安全面における改良とプロテオーム解析の試み
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概要
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Proteomics is a powerful tool to understand the dynamics of proteomes, change in protein components of living cells, with the various environmental stimuli. Two dimensional gel electrophoresis (2-DE) is useful for the analysis of relative protein abundance. Out of several 2-DE, two dimensional electrophoresis of radical-free and highly reducing (RFHR) method developed by Wada is very powerful in analysis especially in dynamics of basic proteins such as proteomes of ribosomes. In this study, we tried to improve the equipment in the safety for use and carried out in order to observe separation patterns of the proteins in deep-sea piezophilic and psychrophilic bacterium, Shewanella violacea DSS12. The experimental conditions of the RFHR 2-D PAGE with or without pre-run and reductants in the electrophoretic system, were also tested to compare the patterns of changes in protein components. This method, RFHR 2-D PAGE described here, will be useful for the characterization of the functional proteomics of extremophiles.
- 近畿大学の論文
- 2003-12-20
著者
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