深海微生物由来EPA合成遺伝子群の構造解析
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概要
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Gene cluster for the eicosapentanoic acid (EPA) synthesis from the deep-sea piezophilic bacterium Shewanella violacea strain DSS12, was cloned and sequenced by plaque hybridization. The clones designated lepa_l1(18kb) and lepa_2 (17kb) were contained 7ORFs from ORF1 to ORF7. Through database analysis of these ORFs, the frames from ORF3 to OFR6 were found as gene cluster involved in EPA synthesis. The cluster contains the genes for pfaA (ORF3), pfaB (ORF4), pfaC (ORF5), pfaD (ORF6) in this order. Comparison of the clusters with same genus S. oneidensis which does not produce EPA, showed that S. oneidensis lacks the pfaB gene, suggesting at least the importance of the gene for EPA synthesis in S. violacea.
- 近畿大学の論文
- 2003-12-20
著者
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