Parallel netCDFインタフェースによる計算機間入出力操作の試み(HPCシステム)
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概要
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netCDF(Network Common Data Form)は、計算アプリケーションにおける可搬性のあるデータ形式をサポートするインタフェースを定めており、様々な計算アプリケーションで利用されている。さらに近年、並列入出力機能をサポートしたparallel netCDFが提案されている。parallel netCDFでは、並列入出力部分の機能をMPI-I/Oのインタフェースを用いる事で実現している。異なるMPIライブラリを持つ計算機間でもこの機能を実現するために、異機種の計算機間で透過的なMPI-I/O操作を実現するStampiを用い、いくつかの関数について、試験的に機能の実装を行なった。この新しく実装した機能の性能をネットワークで繋がれたPCクラスタ間で計測を行ない、データ長が大きい時には、十分使用できる事を確認した。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2005-10-07
著者
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