白色腐朽菌由来リグニンペルオキシダーゼ遺伝子およびマンガンペルオキシダーゼ遺伝子の検出
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概要
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白色腐朽菌は木材腐朽時にリグニン分解酵素を生産し,木材中のリグニンを低分子化させることが知られている。その中でも,マンガンペルオキシダーゼ(MnP)やリグニンペルオキシダーゼ(LiP)などのヘムペルオキシダーゼファミリーに属する酵素はリグニン分解に重要な役割を果たしている酵素の一つであると考えられている。本研究では,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法を用いてMnP やLiP をコードする遺伝子を特異的に増幅可能な技術の確立を試みた。その結果,新規に設計したMnP_F1およびMnP_R1のプライマー対を用いることで,Trametes versicolor,Pycnoporus cinnabarinus,Pycnoporus coccineus,Irpex lacteus といった白色腐朽菌由来のMnP 遺伝子もしくはLiP 遺伝子を特異的に増幅できることが明らかとなった。また,本法を腐朽材に適用したところ,腐朽材からも多様なペルオキシダーゼ遺伝子が検出された。さらに,変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)法を利用して,LiP 遺伝子とMnP 遺伝子の分離を試みたところ,両遺伝子に由来するバンドが明確に分離されることが明らかとなった。このことから,本プライマーを用いたPCR 産物のDGGE 解析は,多様なリグニン分解酵素遺伝子を含む自然界由来の腐朽材試料を研究対象とした場合に極めて有効であることが示唆された。
著者
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吉田 誠
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品バイオテクノロジー研究領域
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吉田 誠
東京農工大学
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中田 裕治
東京農工大学 農学部 環境資源科学科
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吉田 誠
東京農工大 農
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橋本 薫
東京農工大学 農学部 環境資源科学科
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石森 彩
東京農工大学 農学部 環境資源科学科
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橋本 広祐
東京農工大学 農学部 環境資源科学科
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大坂 典子
東京瓦斯株式会社 基盤技術部 技術研究所
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