PhysioDesignerを用いた神経系を含む生体生理機能の多階層モデリングならびにシミュレーション(招待講演,合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般)

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概要

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システムバイオロジー,統合的生命科学という新しい研究分野の発展にともない,多階層的な生理機能の数理モデルならびにそのシミュレーションが果たす役割の重要性が増してきている.本稿では,そのようなモデル開発ならびにシミュレーションをサポートするために提案されたモデル記述言語PHML,ならびにアプリケーションであるPhysioDesignerついて概説する.PhysioDesignerは,ユーザーがグラフィカルなインターフェイスを用いて階層的生理機能の数理モデルを構築できるモデリングプラットフォームである.モデルはPHML形式で保存される.これらのモデルのシミュレーションはFlintと呼ばれるアプリケーションを用いて実行できる.また,PHMLと互換性のあるISML形式のモデルデータベースがphysiome.jpで公開されている.これらのツール群により統合的生命科学におけるモデリングならびにシミュレーションをサポートする.
一般社団法人電子情報通信学会の論文
2012-06-21

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