23aGN-4 Transform and Relax Samplingによるタンパク質の構造変化解析(23aGN 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 2011-08-24

著者

• 北尾 彰朗

  東大分生研

• 北尾 彰朗

  東京大学分子細胞生物学研究所:jst Crest

関連論文

• 1P037 MutTの基質結合にともなう構造変化と基質認識(蛋白質 B) 構造・機能相関))
• 1P058 MutTの構造変化と基質認識の関連(蛋白質 B) 構造・機能相関)
• 分子動力学法によるMutTの8-oxo-dGMP認識機構解明
• 20aED-2 中性子非弾性散乱によるタンパク質の低エネルギーダイナミクスに対する水和効果(20aED 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 22aWB-5 分子シミュレーションと中性子干渉性散乱による蛋白質表面における水の集団運動の観察(22aWB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 23pRC-6 蛋白質の非干渉性中性子弾性散乱データに関する理論的考察(23pRC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 3P063 非干渉性弾性中性子散乱実験に見られる非ガウス性からの蛋白質ダイナミクス情報抽出の試み(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 3P098 非干渉性弾性中性子散乱プロファイルと蛋白質ダイナミクスの相関(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 分子動力学計算を用いた活性部位の動的性質の解明
• 28pVC-4 分子シミュレーションで探る蛋白質のテラヘルツ時間領域分光データー(28pVC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1P079 分子シミュレーションと中性子干渉性散乱で探る蛋白質の協奏的運動(蛋白質(計測解析の方法論),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 19pTC-4 非干渉性中性子散乱によるタンパク質の動力学転移における水和水の挙動解析(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 23pRC-5 中性子非弾性散乱によるタンパク質ダイナミクスの水和効果(23pRC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 27aTH-8 分子シミュレーションで探る中性子干渉性散乱による蛋白質のドメイン運動観測の可能性(27aTH 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 蛋白質の効率的機能を支えるメカニズム--蛋白質のエネルギー地形とダイナミクス
• 3P038 分子シミュレーションによる蛋白質のボゾンピーク研究(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 21pXG-4 分子シミュレーションで探る中性子準弾性散乱による蛋白質の非調和運動観測の可能性(生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1P080 分子シミュレーションで探る蛋白質中性子非弾性散乱実験の可能性(蛋白質 E) 計測・解析の方法論)
• 15aTA-1 分子シミュレーションによる蛋白質のボゾンピーク研究(生物物理, 領域 12)
• 1J1600 分子シミュレーションによる生体高分子の中性子散乱スペクトル解析 : 蛋白質の協奏的運動は(Q,w)-spaceのどこで観測できるのか?(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 細菌べん毛繊維は分子間相互作用とフラストレーションを利用して超らせん構造の変化を制御する
• 3P198 Dynamic residue paring for the universal joint mechanism of the flagellar hook
• 2P135 Mechanism of flagellar hook bending flexibility revealed by molecular dynamic simulation of protofilament extension and compression
• 1P056 分子動力学シミュレーションによる細菌べん毛繊維の超らせん構造変化(蛋白質 B) 構造・機能相関)
• 27aVC-8 全原子モデルと粗視化モデルを併用した生体高分子系における効率的自由エネルギー計算手法の開発(27aVC 光応答・光散乱・化学反応・状態変化・シミュレーション手法,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 3S1-5 レア・イベントとしてのタンパク質ダイナミクスと複合体形成(3S1 レア・イベントから創薬へ,第46回日本生物物理学会年会)
• 2P285 バクテリオファージT4の感染初期過程(生体膜・人工膜,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P013 Dynomics portal : An integral effort on developing and organizing dynamics web servers/databases(Proteins-structure and structure-function relationship,Oral Presentations)
• 1P007 タンパク質ユビキチンのNMR緩和と分子シミュレーション(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P100 リガンド結合とドメイン運動に伴う蛋白質の水和構造変化(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など)))
• 大規模分子動力学法で観る細菌べん毛繊維の構造変化
• 3K0945 分子動力学シミュレーションによるべん毛タンパク質flagellinのダイナミクス(1.蛋白質(B)構造・機能相関,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
• 1P33 lysozyme結晶のラマンスペクトルの基準振動による解析
• 生体超分子のユニバーサルジョイント--in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム (生命秩序を担う生体超分子) -- (巨大構造体の形成・機能発現における超分子相互作用)
• さまざまな観点からのタンパク質MDのトラジェクトリ必要長の計算
• 1K1615 多次元パラボラエネルギーモデルによるタンパク質MDのトラジェクトリ必要長の計算(1.蛋白質(C)物性(E)計測・解析の方法論,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• JAMモデルを使って生体高分子のゆらぎを探る(2000年度基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開2」,研究会報告)
• 2P058多次元パラボラエネルギーモデルを用いたタンパク質立体構造サンプリング問題へのアプローチ
• 2P030中性子散乱スペクトルの理論的解析 : 蛋白質の動的構造に対する溶媒とポテンシャル面非調和性の効果
• S1E01蛋白質のダイナミクスをどのように観るか?
• 主成分分析を使って眺めた蛋白質のエネルギー地形(研究詳解) (特集 地図を描く・風景を眺める--主成分分析・多次元尺度法とその周辺)
• Val-Ala変異型蛋白質の安定性変化に関する理論的解析
• 20pEC-1 タンパク質が引き起こす生体膜変形のダイナミクス(20pEC 領域12,領域11合同シンポジウム:ナノからマイクロスケールまでの生体膜の変形・相分離ダイナミクス,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1P046 生体分子の自由エネルギー地形の解析(蛋白質(機能・計測解析の方法論・蛋白質工学),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 21pTC-6 生体分子を対象とした新規アンブレラサンプリング法の開発(化学物理一般(光応答・電子状態・シミュレーション),領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 1P53 SH 3ドメインの基質認識におけるループの働き
• 28aGV-5 異方性の高いシステムのためTransform and Relax Sampling(28aGV 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 実験と理論のハイブリッドから機能に関わるタンパク質のダイナミクスを観る
• 理論計算からタンパク質の変性構造を探る
• 22pXA-1 中性子非弾性散乱から蛋白質ダイナミクスのどのような情報が得られるか?
• 1D1600 中性子散乱スペクトルの理論的解析
• 1D0945 新しい立体構造精密化法を用いてTCRの溶液中の構造とダイナミクスを探る
• 2PA056 NMRと分子シミュレーションから生体高分子の立体構造とダイナミックスを決定するための新たな方法
• 2Q11 天然状態における蛋白質のダイナミックスとエネルギーランドスケープ
• 1Q40 蛋白質の安定性と変性状態の構造
• 23aGN-4 Transform and Relax Samplingによるタンパク質の構造変化解析(23aGN 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 23pGN-5 機能を生み出すタンパク質の異方的ダイナミクス(23pGN 領域12シンポジウム:ハイ・パフォーマンス・コンピューティング(HPC)を使った生体分子のシミュレーション:その現状と課題,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク