745 生体分子機械の力学的特徴 : 粗視化分子動力学計算による比較研究(基調講演,OS21.細胞・生体分子の計算バイオメカニクス(2),オーガナイズドセッション)
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概要
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本研究では、弾性ネットワークモデルを用いた粗視化分子動力学計算により、生体分子機械として働く様々なタンパクで、構造歪みからの緩和過程のダイナミクスを比較する。特に、非線形性の強い運動に注目して、これら分子機械の力学的・構造的特徴について議論する。これら分子のモデルでは、緩和過程は概ね秩序立っている一方で、分子の種類ごとの特徴も見られる。例えば、分子モーターの1種であるKIF1Aでは、緩和の著しい非線形性・遅延が生ずる。これは、立体障害のため、動きに順序関係が生ずることによる。このような緩和過程の特徴と分子の動作メカニズムとの関係についても考察する。
- 一般社団法人日本機械学会の論文
- 2008-11-01
著者
-
柳田 敏雄
大阪大学生命機能研究科
-
上田 昌宏
大阪大学大学院 生命機能研究科 ナノ生体科学講座
-
上田 昌宏
大阪大学生命機能
-
冨樫 祐一
大阪大学生命機能
-
柳田 敏雄
大阪大学大学院生命機能研究科
-
柳田 敏雄
大阪大・基礎工・医
-
柳田 敏雄
大阪大学基礎工学部
-
柳田 敏雄
大阪大学大学院
-
Mikhailov Alexander
Fritz Haber Institute Of The Max Planck Society
-
冨樫 祐一
大阪大学サイバーメディアセンター
-
冨樫 祐一
大阪大学大学院生命機能研究科
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