Short readシーケンサーデータに対する複次重複処理による結合信頼性向上の検討
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概要
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次世代シークエンサの開発により、読み取り配列の長さを短くし並列処理を行うことで、配列の高速処理が可能になった。またアセンブルにおいて k-mer を利用することで、シーケンサのリードミスにも対処ができている。しかしkの値によってアセンブルの精度が左右されている。そのため未知の配列に対して de novo アセンブルを行う際には配列結合の信頼性が確保できない。そこで本報告では、複数の k-mer を利用することで配列結合の信頼性を向上させることについて検討する。
- 2011-11-24
著者
-
名嘉村 盛和
琉球大学工学部情報工学科
-
名嘉村 盛和
琉球大学工学部
-
名嘉村 盛和
Graduate School Of Engineering And Science University Of The Ryukyus
-
岡崎 威生
琉球大学工学部情報工学科
-
大城 絢子
Information Engineering Course, Graduate School of Engineering and Science, University of the Ryukyu
-
岡崎 威生
Faculty of Engineering, University of the Ryukyus
-
安富 祖仁
Information Engineering Course, Graduate School of Engineering and Science, University of the Ryukyu
-
名嘉村 盛和
Faculty of Engineering, University of the Ryukyus
-
安富 祖仁
Information Engineering Course Graduate School Of Engineering And Science University Of The Ryukyus
-
大城 絢子
Information Engineering Course Graduate School Of Engineering And Science University Of The Ryukyus
-
岡崎 威生
Faculty Of Engineering University Of The Ryukyus
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