複数の準最小木を考慮した遺伝子発現データクラスタリング(コンカレントシステム, 一般)
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概要
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本論文では, 遺伝子発現データクラスタリング問題において, 良質な解を求めるために, 複数の最小木に基づくクラスタリング手法を提案する. 提案手法では, 各遺伝子の発現データを頂点とする完全グラフに発現データ間の非類似度を表す辺の重みを付加したものを入力データとし, 最小木を求めるプリムのアルゴリズムを重みの誤差を考慮しながら適用することによって複数の準最小木を求める. この時, 求められた木からk-1本の辺を抜くことでk個の部分木を求めることができる. これらの部分木がクラスタに対応づけられることになる. どのk-1本の辺を選択するかによってクラスタリングの結果が変わるため, 最適化手法の遺伝アルゴリズムを適用して進化的に質の高いクラスタリングになるように辺を選択する. 計算機実験により提案手法の有効性を示す.
- 2005-01-20
著者
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