グラフィックカードを用いた水表面張力の高速分子動力学シミュレーション
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概要
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古典分子動力学シミュレーションは界面現象を定量的に観察できる手法である.しかし高い精度の界面系の分子動力学シミュレーションに膨大な計算を必要とする.本研究では,まず高速な分子動力学シミュレーションを行うために,近年発達の著しいグラフィックカードを用いた計算環境を構築した.テスト計算の結果,グラフィックカードを用いて単精度で力の結果を行っても計算精度に問題がなかった.また通常の PC に比べて,O[N2] のアルゴリズムどうしで約 70 倍,O[N log N] の高速なアルゴリズムどうしで 13.4 倍の高速化が確認できた.本計算環境を用い水気液界面の計算を大規模な系で行い,精度の高い界面張力の値を得た.結果,SPC/E モデルは実験値よりも 10 mN/m 程度低い値を示すことが確認された.
- 2009-07-02
著者
-
成見 哲
慶応大学 理工学部機械工学科
-
成見 哲
慶應義塾大学理工学部
-
泰岡 顕治
慶應義塾大学理工学部機械工学科
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泰岡 顕治
慶應義塾大学 理工学部機械工学科
-
泰岡 顕治
慶應義塾大学
-
泰岡 顕治
理研 慶大理工
-
成見 哲
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
坂牧 隆司
慶應義塾大学大学院理工学研究科
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