大規模クラスタにおけるソケットダイレクトプロトコルSDPの性能評価(インタコネクト, SWOPP武雄2005 (2005年並列/分散/協調処理に関する「武雄」サマー・ワークショップ))
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
ソケットダイレクトプロトコルSDPは, 伝統的なソケットストリームAPIを提供しつつ, RDMAプロトコルに直接マッピングすることにより高性能な通信を可能にするプロトコルである.本報告ではInfiniBand上に実装されたSDPの通信性能を, 実際の大規模クラスタにおいて評価し, ギガビットイーサネットTCPとIPoIBとも比較した.1バイトメッセージの通信レイテンシは, SDPは24.8usec, IPoIBは33.2usec, ギガビットイーサネットは21.6usecで, SDPはギガビットイーサネットに対して優位性はない.しかし64KBメッセージの一方向ストリーム通信のスループットは, IPoIBが1763Mbit/sec, ギガビットイーサネットが941Mbit/secに対して, SDPは5378Mbit/secで, InfiniBandの理論転送レートの70%近くを達成している.さらにSDPは, 64のクライアントからのマルチストリーム片方向通信に対し, 総スループットとして7853Mbit/secを達成し, ギガビットイーサネットやIPoIBに比べ約7.8倍と2.6倍の高バンド幅を利用できる.SDPのCPU使用率は, IPoIBに比べ低いものの, ギガビットイーサネットに対しては優位性が観測されなかった.SDPは小さなメッセージ通信に関しては利点が少ないが, 大きいメッセージの通信にはレイテンシ, スループット共に有利であることが確認された.
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2005-07-28
著者
-
姫野 龍太郎
理化学研究所
-
渡辺 義人
成蹊大学理工学部
-
姫野 龍太郎
理化学研究所次世代計算科学研究開発プログラム
-
黒川 原佳
理化学研究所情報基盤センター
-
緑川 博子
成蹊大学理工学部情報科学科
-
緑川 博子
成けい大 理工
-
黒川 原佳
理化学研究所
-
緑川 博子
成蹊大学理工学研究科理工学専攻
-
緑川 博子
成蹊大学理工学研究科
関連論文
- バックスピンする球体に働く負のマグナス力 : 飛翔実験による測定
- 高効率数値血流解析システムの開発
- ジャイロボールのドラッグクライシス
- 遠隔メモリスワップのためのユーザレベルソフトウエアDLMの性能評価(ネットワーク,SWoPP佐賀2008-2008年並列/分散/協調処理に関する『佐賀』サマー・ワークショップ)
- 遠隔メモリを利用する大容量メモリシステムDLMとコンパイラ(計算環境)
- 530 有限要素法とCT osteoabsorptiometryを用いた股関節の応力分布の検討(OS4-2:関節のバイオメカニクス(2),OS4:関節のバイオメカニクス)
- 魔球のシミュレーション(シミュレーションの世界)
- 粉末積層造形法を用いた人工骨成形法の提案 : 成形骨の多孔質性
- 粉末積層造形法を用いた人工骨成形法の提案 : 成形性の検討
- 試料内部3次元情報取得システムによるアルミニウム合金ダイカスト内部の鋳巣観察
- 逐次精密切削加工による試料内部3次元情報取得システムの開発
- APP-122-PM 腎癌患者の腹腔鏡手術を予行演習する : リハーサル型腹腔鏡手術シミュレータの開発(総会賞応募ポスター,第97回日本泌尿器科学会総会)
- イメージベースト血管モデルを用いた腎動脈分岐部の血流動態の解析(イメージベースト連成バイオメカニクス)
- 血管形状自動抽出法の開発と腎動脈の血流解析への応用
- 22.全身動脈樹を模した心血管系シミュレーションによる,血管粘弾性の血圧変化に与える影響解析(第26回中国四国支部大会抄録)
- 経路ベース木構造による主幹・側幹分岐型動脈の三次元構造の表現(画像認識,コンピュータビジョン)
- 計算力学
- マイクロCTによる細気管支形状計測
- 大規模クラスタにおけるソケットダイレクトプロトコルSDPの性能評価(インタコネクト, SWOPP武雄2005 (2005年並列/分散/協調処理に関する「武雄」サマー・ワークショップ))
- グリッド環境下における並列分子動力学ポータルサイトの構築(グリッド)
- グリッド環境下における並列分子動力学ポータルサイトの構築
- MRI画像における血管領域抽出手法構築を目的としたPhase Contrast法の流速計測特性評価
- 517 MRI 画像における流速情報に基づいた血管領域自動抽出法の提案
- MRIの多機能性 : 形状から弾性率まで
- J0203-1-2 コイルが留置された脳動脈瘤モデル内の流れに関する研究(医療診断のためのマルチスケール血流動態計測と解析(1))
- J0102-2-3 Euler型解法FEMにおける固体-固体インターフェースを用いた接触問題の高精度化(次世代生命体統合シミュレーション(2))
- 動脈グラフの閉路の真偽判定法(生体工学)
- 多重蛍光の定量的分析のための独立成分分析による線形性評価に関する研究(生体工学)
- 331 実形状末梢気道内の気流シミュレーション(OS6-5:生体モデリングとシミュレーション(5),OS6:生体モデリングとシミュレーション)
- 109 Euler型解法FEMを用いた軟組織穿刺時の摩擦力に対する組織の静水圧の影響の検討(OS6-2:生体モデリングとシミュレーション(2),OS6:生体モデリングとシミュレーション)
- 医療現場での計算工学適用の現状と展望
- 生体力学シミュレーションのための人体モデル構築
- 525 イメージベース解析を用いた中敷の設計(OS2-7:生体モデリングとシミュレーション(7),OS2:生体モデリングとシミュレーション)
- SOR法を用いた可変的前処理付き一般化共役残差法
- GCR法に対する可変的前処理法の性能評価 (偏微分方程式の数値解法とその周辺II)
- 野球の変化球とトライボロジー
- 25pWA-10 プラスティック材料のマイクロ波誘電加熱の解析 : 電磁波-熱物性連成シミュレーション(25pWA 環境物理(総論・地球システム・物質循環・環境評価・環境技術・環境政策・廃棄物・電磁波・その他),領域13(物理教育,物理学史,環境物理))
- 614 超弾性を考慮した生体組織の物性値データベース構築(OS2-6:生体モデリングとシミュレーション(6),OS2:生体モデリングとシミュレーション)
- 1028 MR画像を用いた生体力学計測への静電モータの応用(G02-3 バイオエンジニアリング(3),G02 バイオエンジニアリング)
- 501 統合力学シミュレーションのためのヒューマンモデル構築(OS8-1:デジタルヒューマン,オーガナイズドセッション8:デジタルヒューマン)
- 1次元数値計算モデルを用いた上腕動脈内における圧脈波波形変化の解析
- 頻度に応じたカラーヒストグラムの拡張による生体組織領域抽出
- 3. 生体力学シミュレーションのためのボクセル人体モデルの開発(医療のためのディジタルヒューマン技術)
- 生体形状データベース構築(生体研究におけるモデル化と応用)
- B207 脳動脈のネットワーク構造における血流シミュレーション(B2-2 生体流体工学1)
- B206 医療画像に基づく脳血管血流シミュレーション(B2-2 生体流体工学1)
- 3次元内部構造顕微鏡とスーパコンピューターを用いたマウス全身の3次元高精細観察
- 3次元内部構造顕微鏡を用いたマウス3次元データベース作成の試み
- 生物形状の数値化の試み : 理研:生体形状情報の数値化及びデータベース構築研究での取り組み(生物の形をどう捉えるか)
- 3次元内部構造顕微鏡を用いた生体軟組織の半自動FEM解析メッシュ生成
- 3次元内部構造顕微鏡を用いたマウス系統のよる3次元構造の違いの観察
- 生物形状の数値化の試み : 理化学研究所で開始した生体形状情報の数値化及びデータベース構築研究
- ラット細気管支の局所コンプライアンスの評価
- 414 皮質骨リモデリング in vivo 実験モデルの基礎的検討
- カットセル直交等間隔格子による非圧縮粘性流のシミュレーション : V-CADデータを直接利用する任意形状流れ場の数値解析(流体工学,流体機械)
- 心血管系数値解析のための1次元数値計算 : 一般化粘弾性モデルを用いた高速数値計算モデル(生体材料のバイオエンジニアリング)
- 並列CFD計算における非同期通信-計算重複法
- 1220 1 次元多分岐流体モデルを用いた循環器系数値流体解析
- 三次元ポアソン方程式に対する領域分割法の分割方法による性能への影響
- 三次元ポアソン方程式に対する領域分割法の分割方法による性能への影響
- 疎結合連成計算による弾性円柱の流体抵抗について
- 疎結合計算による非圧縮・非定常流体と完全弾性体の連成解析(流体工学, 流体機械)
- クリロフ部分空間法に対する前処理方式と収束判定について
- PHANToMを用いたガイドワイヤー遠隔操作の試み
- A-32 バックスピンする球体に働く負のマグナス力 : 飛翔実験による測定(野球2(FD))
- 非適合有限要素メッシュ接続を用いた高周波電磁界解析へのA-φ法の導入
- 辺要素有限要素法による非適合境界面を考慮した周波数領域電磁波解析
- 被加熱体の回転運動と温度依存性の複素誘電率を考慮した電磁波・熱伝導連成解析
- 有限要素法によるステラファンの回転運動を考慮した誘電加熱解析
- 赤血球によって惹起される血液凝固反応のレオロジー的解析 : 年令、経月変動について
- 遠隔メモリを利用する分散大容量メモリシステムDLMの設計と10 Gb Ethernetにおける初期性能評価
- PCクラスタの現状と導入のための基礎知識
- 計算力学
- A-9 プロ野球投手の投球動作の生体力学的エネルギ解析(野球1(投球他))
- しわ状予混合火炎の直接数値計算
- 非定常固気混相噴流のLES(熱工学,内燃機関,動力など)
- 心臓血管系の血流シミュレーション
- 0435 全身循環器系と動脈樹を模した心血管系数値解析に与える血管粘弾性の影響(GS14-2:モデリングとシミュレーション2)
- 被加熱体の回転運動と温度依存性の非線形誘電率を考慮した電磁波・熱伝導連成解析
- 誘電率に温度非線形性を考慮した高周波電磁界と温度場の連成解析
- 硬式野球ボールに働く空気力の測定
- 野球ボールにかかる空気力の測定
- FEM数値シミュレーションによる強膜バックリング術後屈折変化の検討
- アクティブ・ディンプルを有する球周囲の流れの数値解析(流体工学,流体機械)
- アクティブ・ディンプルを有する球周囲の流れの数値解析
- 可視化情報学会誌の歴史と数値シミュレーションの可視化
- 異機種複合システムRSCC(Riken Super Combined Cluster)とその将来計画(SWOPP武雄2005 (2005年並列/分散/協調処理に関する「武雄」サマー・ワークショップ))
- 血流のシミュレーションと医療への応用(デジタルヒューマン技術とその工学的応用)
- 理研における生体力学シミュレーションの現状と今後
- サイエンス・エンジニアリング分野におけるCGによる可視化
- 理化学研究所における生体力学シミュレーション研究プロジェクト(生体シミュレーションと医工学プロジェクト,生体医工学における力学シミュレーション)
- 直列2円柱まわりの流れの相互干渉のシミュレーションによる流体力の再現性の検討
- 直接数値計算による乱流予混合火炎中の乱流エネルギーと乱流スカラー流束の輸送特性の解析とモデリング
- 生体力学シミュレーションの現状と今後
- 臨床応用を目指す循環器系の血流シミュレーション
- 多峰性問題のDeterministic Crowding法適用における初期世代の交叉と突然変異の影響
- ボクセル法による流れ解析とその改良
- 並列有限要素法と解適合型直交格子法による流れと熱の数値シミュレーション
- 工学的な設計のための流れと熱の数値シミュレーション(熱・流体・構造連成問題)
- 乱流予混合火炎の直接数値シミュレーション(反応・多相系 燃焼・反応(2),一般講演)