(5)ジャガイモSウイルスのアンデス系統と普通系統の分子性状比較と分子識別
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概要
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ジャガイモSウイルス(PVS)普通系統H株ゲノムの全塩基配列については既に報告した(上田ら,2002).今回新たに九州産アンデス系統(別名南部潜在ウイルス) Na1株ゲノムの全塩基配列を決定した.PVS-Na1ゲノムはポリA鎖を除いて8483塩基よりなり,PVS-Hに比べ2塩基少なく,両者の塩基配列相同性は79%であった.また,2分離株以外に普通系統5株とアンデス系統7株についてもゲノム3'末端領域約1.6kの塩基配列を解析した.それらの比較より,どちらかの系統のみを特異的に増幅するセンスプライマーをORF4内の2箇所に,また上流のORF3内には両系統を増幅するプライマーを作成した.これらを用いたマルチプレックスRT-PCRでPVS検出と系統識別を行う分子診断法を開発した.
- 日本植物病理学会の論文
- 2003-02-25
著者
-
大島 一里
佐賀大農
-
上田 一郎
北大院農
-
畑谷 達児
北大院農
-
佐藤 仁敏
種管セ
-
上田 浩司
北大院農
-
佐藤 仁敏
種苗管理セ
-
八木橋 悠
北大院農
-
佐藤 仁敏
種苗管理センター
-
今井 杏子
北大院農
-
久保 真一
北大院農
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