Phylogenetic profiling of Arabidopsis genes by monitoring spatial gene expression using cDNA microarrays
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
Arabidopsis cDNA microarray analysis was performed for 5,722 genes using leaf, stem, root and flower mRNA as targets. We identified 55, 22, 21, and 131 genes expressed specifically in leaves, stems, flowers and roots, respectively. Statistical cluster analysis revealed that the roots were the most distant and the leaves and flowers the most related organs with regards to gene expression. K-means clustering revealed that the clusters for leaf-specific genes tended to mainly have genes for plastid-localized proteins, while the cluster for predominantly root-specific genes was mainly secretory proteins.
- 日本植物細胞分子生物学会の論文
- 2005-03-01
著者
-
新名 惇彦
阪大工
-
Shinmyo A
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
新名 惇彦
奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科
-
SHINMYO ATSUHIKO
Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science and Technology
-
Yokota A
Laboratory Of Applied Microbiology Department Of Bioscience And Chemistry Faculty Of Agriculture Hok
-
Shinmyo Atsuhiko
Graduate School Of Biological Science Nara Institute Of Science And Technology
-
Shinmyo Atsuhiko
Nara Insti. Sci. Technol. Nara
-
Shinmyo Atsuhiko
Department Of Biotechnotogy Faculty Of Engineering Osaka University:department Of Bioscience Nara In
-
Yoshida Kazuya
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
Yokota A
Nara Inst. Of Sci. And Technol. (naist) Nara Jpn
-
Yokota Akiho
Plant Molecular Physiology Research Institute Of Innovative Technology For The Earth (rite)
-
Yokota Akiho
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
Yokota Akiho
Plant Molecular Physiology Laboratory Research Institute Of Innovative Technology For Teh Earth (rit
-
Yamakawa Seiyei
Graduate School Of Biological Science Nara Institute Of Science And Technology
-
Yamakawa Seiyei
Technology Department Research Association For Biotechnology
-
Ando Kohei
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
Sakagami Y
Nagoya Univ.
-
KOHCHI Takayuki
Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science and Technology
-
Kohchi T
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
Kohchi T
Laboratory Of Plant Molecular Biology Department Of Agricultural Chemistry Faculty Of Agriculture Ky
-
Kohchi Takayuki
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
Yokota A
Graduate School Of Biological Sciences Nara Institute Of Science And Technology
-
新名 惇彦
奈良先端大
-
Sakagami Youji
Laboratory Of Bioactive Natural Product Chemistry Graduate School Of Bio-agricultural Sciences Nagoy
-
Yamakawa Seiyei
School Of Agricultural Sciences Nagoya University
-
Yokota Akiho
Graduate School Of Biological Science Nara Institute Of Science And Technology
関連論文
- 1E12-1 中度好塩性細菌Halomonas elongate OUT30018株における金属応答遺伝子の発現解析(遺伝子工学・核酸工学,一般講演)
- キュウリアスコルビン酸オキシダーゼ遺伝子のプロモーターの傷害誘導性シスエレメントに結合する新規タンパク質
- ハロモナス細胞表層ディスプレイシステムを用いた高塩環境浄化に有用な金属結合ドメインの探索(コンビバイオとナノバイオのコラボによる新しい世界の開拓-バイオテクノロジーの未来のかたち-)
- 2S1AM2 ハロモナス細胞表層ディスプレイシステムを用いた高塩環境浄化に有用な金属結合ドメインの探索(ライフサーベイヤー構築をめざしたナノバイオとコンビバイオの融合の新しい展開,シンポジウム)
- 3F10-2 植物工場に供するブタ浮腫病ワクチン生産レタスの作製(光合成微生物,植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学,免疫工学,一般講演)
- 2A13-2 環境ホルモン分解能の高いミニバラを用いた高度水処理システム(環境工学,廃水処理技術,一般講演)
- 1I15-1 中度好塩性細菌Halomonas elongata OUT30018株を利用した細胞表層工学技術の開発と塩類集積環境の重金属浄化への応用(環境浄化・修復・保全技術,一般講演)
- 2J10-1 西洋ワサビペルオキシダーゼClaの液胞局在化機構(光合成微生物/植物細胞工学,植物組織培養,植物育種工学/動物細胞工学,動物組織培養,一般講演)
- 2J10-2 イネの高親和性K^+輸送体OsHKTのイオン輸送特性(光合成微生物/植物細胞工学,植物組織培養,植物育種工学/動物細胞工学,動物組織培養,一般講演)
- 2J10-3 イネの高親和性K^+輸送体OsHAKを利用した植物細胞のイオン輸送能の改良(光合成微生物/植物細胞工学,植物組織培養,植物育種工学/動物細胞工学,動物組織培養,一般講演)
- 植物小胞輸送工学(「植物バイオリアクターによる外来タンパク質生産」)
- 1D14-4 イネの高親和性K^+輸送体遺伝子を導入した細胞のイオン輸送特性(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・光合成微生物,一般講演)
- 3B14-1 中度好塩性細菌Halomonas elongataの高塩濃度およびアルカリ性環境における金属耐性(環境浄化・修復・保全技術,一般講演)
- 2F15-5 シロイヌナズナ器官特異的プロモーターの網羅的収集とin plantaにおける活性評価(代謝工学・メタボローム・生体情報工学(バイオインフォマティクス),一般講演)
- 2K10-3 形質転換タバコにおける西洋ワサビペルオキシダーゼC生産(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- 2J16-5 ペルオキシダーゼを高効率に分泌生産する形質転換タバコの作製
- 2K11-1 DNAマイクロアレイを用いたシロイヌナズナの根特異的な塩応答性遺伝子の探索・単離(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- 2K11-2 シロイヌナズナの根における塩ストレス応答性プロモーターの単離(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- 植物バイオテクノロジーの基礎および開発研究 : 多重遺伝子導入技術の開発とその応用
- 1A16-2 多重遺伝子連結技術の開発とその自動化(遺伝子工学・核酸工学,一般講演)
- 2K09-5 長鎖DNAを付加し遺伝子導入した植物におけるジーンサイレンシングの減少(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- Improving salt tolerance in plant cells
- キシラナーゼの立体構造(酵素-糖質関連酵素-)
- バイオの世紀の生物工学(北日本支部シンポジウム開催報告)
- 関西における産学連携推進の動き(関西支部2000)
- 日本学術会議生物工学研究連絡委員会報告
- Cadmium-tolerance of transgenic Ipomoea aquatica expressing serine acetyltransferase and cysteine synthase
- Simultaneous expression of serine acetyltransferase and cysteine synthase results in enhanced sulfate uptake and increased biomass in Ipomaea aquatica
- Hyper-assimilation of sulfate and tolerance to sulfide and cadmium in transgenic water spinach expressing an Arabidopsis adenosine phosphosulfate reductase
- Genetic Transformation of Water Spinach (Ipomoea aquatica)
- ミジンコウキクサの形質転換法の確立
- 藪田セミナー 「光合成生物の新機能の開発と利用」
- Effect of the sequence context of the AUG initiation codon on the rate of translation in dicotyledonous and monocotyledonous plant cells(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- The 5'-Untranslated Region of the Oryza sativa Alcohol Dehydrogenase Gene Functions as a Translational Enhancer in Monocotyledonous Plant Cells(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- Preferential Translation Mediated by Hsp81-3 5'-UTR during Heat Shock Involves Ribosome Entry at the 5'-end Rather than an Internal Site in Arabidopsis Suspension Cells(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- (40) 形質転換イネにおけるイネperoxidase遺伝子の発現 (日本植物病理学会大会)
- (39) 形質転換タバコ植物中におけるイネperoxidase遺伝子のプロモーター解析 (日本植物病理学会大会)
- 2H11-1 イネの K^+ 輸送体をコードする HAK 遺伝子の機能解析
- 2K10-5 cDNAマイクロアレイを用いたシロイヌナズナ器官特異的プロモーターの網羅的解析(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- (49)イネセレニウム結合タンパク質遺伝子OsSBPを過剰発現させたイネは耐病性が向上する(関西部会講演要旨)(平成15年度地域部会講演要旨)
- 1D14-2 シロイヌナズナにおけるIRESの探索(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・光合成微生物,一般講演)
- 1D14-3 熱ストレス条件下でも翻訳されるHSP81-2,HSP81-3遺伝子の5'-UTRの特性(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・光合成微生物,一般講演)
- 植物の生物工学的利用のための基盤技術開発とその応用(平成18年度 生物工学賞 受賞)
- 3C-PM1 工学が植物利用の新しい潮流を生み出す : 21世紀植物工場とグリーンアメニティ工学(工学が植物利用の新しい潮流を生み出す-21世紀植物工場とグリーンアメニティ工学-,シンポジウム)
- 日本生物工学会の視点から
- 地球・人類のクリティカルポイント,2050年
- 会長就任にあたって
- バイオの時代を担う学会和文誌に
- 国際シンポジウムIndustrial Microbiology & Biotechnology : A Celebration of Arny's Army and Friends in Japan紹介
- 遺伝子組換え植物, 食品の安全性についての議論
- 黒木猛熊元事務局長を偲ぶ
- 21世紀の基幹技術 : 植物バイオテクノロジー
- Artificial Control of Transgene Expression in Chlamydomonas reinhardtii Chloroplast Using the lac Regulation System from Escherichia coli(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- Distinct DNase I hypersensitive sites are absent from promoters of transcriptionally incompetent genes in Arabidopsis
- 2E16-3 シロイヌナズナにおけるMARの結合モデル(遺伝子工学・核酸工学,一般講演)
- 「古都奈良の新世紀植物機能活用技術の開発」の紹介(談話室)
- Mapping and Characterization of DNase I Hypersensitive Sites in Arabidopsis Chromatin
- Tobacco RETINOBLASTOMA-RELATED protein is phosphorylated by different types of cyclin-dependent kinases during the cell cycle
- Analysis of chromatin condensation states by DNase I sensitivity assay at 500-base resolution in Arabidopsis
- 2Z-PM1 植物の生物工学的利用のための基盤技術開発とその応用(生物工学賞受賞講演)
- Expression of OsHAK genes encoding potassium ion transporters in rice
- Functions of HKT transporters in sodium transport in roots and in protecting leaves from salinity stress
- High-Efficiency Secretory Production of Peroxidase Cla Using Vesicular Transport Engineering in Transgenic Tobacco(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- Resistance to insects in transgenic Solanum plants expressing a peroxidase gene from horseradish
- Phylogenetic profiling of Arabidopsis genes by monitoring spatial gene expression using cDNA microarrays
- Expression of Randomly Integrated Single Complete Copy Transgenes Does not Vary in Arabidopsis thaliana
- Systematic Transient Assays of Promoter Activities for Leaf-Specific Genes Identified by Gene-Expression Profiling with cDNA Microarrays in Arabidopsis thaliana(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- Enhanced Resistance to Blast Fungus and Bacterial Blight in Transgenic Rice Constitutively Expressing OsSBP, a Rice Homologue of Mammalian Selenium-binding Proteins
- Efficient Construction of cDNA Microarrays Utilizing Normalized cDNA Libraries of Arabidopsis thaliana
- 特集にあたって (特集 植物の物質生産プロセス制御基盤技術開発)
- 植物バイオマス増産の必要性と研究課題 (特集 植物バイオマスデザイン--統合バイオリファイナリーの実現に向けて)
- バイオマスエネルギー バイオマスエネルギーが開く社会と産業 (特集 地球温暖化防止技術セミナー)
- アグリバイオビジネスの新展開と中小企業の可能性 (特集1 アグリ+バイオが拓く新市場)
- 人工栽培技術の歴史と現状 (特集 人工栽培--植物工場の要素技術と建築への展開)
- グローバル時代における奈良先端大の取組 (特集 大学等における体制作り)
- 今求められている輸入食品の安全性
- 特集 急がれる石油からバイオへの素材の転換
- 21世紀の課題--植物バイオマスからエネルギー生産
- セレニウム結合タンパク遺伝子を利用した病害抵抗性植物の分子育種 (第21回 バイオテクノロジー シンポジウム 予稿集) -- (ポスターセッションの部 植物利用エネルギー使用合理化工業原料生産技術開発)
- 植物資源にエネルギーと工業生産を託す (Special Issue【特集】 植物の力をバイオ産業に)
- 1D14-1 ターミネーター領域の改変による導入遺伝子の高発現化(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・光合成微生物,一般講演)
- 537 イネペルオキシダーゼ遺伝子の単離と構造
- バイオマス活用の概説 (特集 ハイテクセミナー バイオマス--非バイオ系技術者と語るバイオマスの活用)
- Genome-Wide Analyses of Early Translational Responses to Elevated Temperature and High Salinity in Arabidopsis thaliana
- The HSP Terminator of Arabidopsis thaliana Increases Gene Expression in Plant Cells
- Ribulose 1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase Large Subunit Translation is Regulated in a Small Subunit-Independent Manner in the Expanded Leaves of Tobacco
- 2K10-2 ペルオキシダーゼ遺伝子導入植物におけるリグニン量の増加と耐虫性向上(植物細胞工学・植物組織培養・植物育種工学・生体情報工学,一般講演)
- 究極の環境問題,海洋汚染
- Efficient Translation Destabilizes Transcripts in Chloroplasts of Chlamydomonas reinhardtii (PLANT BIOTECHNOLOGY)
- An E2F-Regulated Reporter Construct is Transcriptionally Activated Following the Transient Expression of Cyclin D in Plants
- The 5'-Untranslated Region of the Tobacco Alcohol Dehydrogenase Gene Functions as an Effective Translational Enhancer in Plant(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- Rice sodium-insensitive potassium transporter, OsHAK5, confers increased salt tolerance in tobacco BY2 cells(PLANT BIOTECHNOLOGY)
- 講演 低炭素化社会実現の切り札,植物バイオ
- バイオマス活用の概説 (新エネルギー戦略 バイオマス) -- (特集 ハイテクセミナー バイオマス--非バイオ系技術者と語るバイオマスの活用)
- Improving salt tolerance in plant cells
- マイクロアレイを用いた植物プロモーターの網羅的探索 (特集 バイオテクノロジーイノベーション(2)単細胞解析をめざしたバイオと異分野の融合がもたらすブレークスルー技術の新潮流)
- 2H11-2 タバコ培養細胞を用いた G1/S 期制御の解析
- 植物による工業原料生産技術の開発 : NEDOプロジェクトの概要
- Activity of the C-terminal-Dependent Vacuolar Sorting Signal of Horseradish Peroxidase C1a is Enhanced by its Secondary Structure
- キュウリアスコルビン酸オキシダーゼ遺伝子のプロモーターの傷害誘導性シスエレメントに結合する新規タンパク質