嫌気共生培養系を利用した未培養系統分類群に属するメタン生成古細菌の分離・培養
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概要
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An anaerobic syntrophic substrate-degrading coculture system was used to isolate uncultivated methanogens that can provide hydrogen at a very low partial pressure. Primary enrichments for methanogens were prepared from ten environmental samples with ethanol, butyrate, and propionate, which are degraded by syntrophic association with anaerobic syntrophic bacteria and hydrogenotrophic methanogens. For comparison, enrichments with hydrogen at a high partial pressure were also prepared with the same inoculum. To identify methanogens in the enrichments, we applied 16S rRNA gene-based clone analysis to all the enrichments. The clone analysis revealed that almost all the clonal sequences obtained from the hydrogen enrichments were closely related to those of previously isolated methanogens, such as species belonging to the genera Methanobacterium and Methanospirillum. However, several clones retrieved from the syntrophic substrate-degrading enrichments were affiliated with uncultured lineages within the order Methanomicrobiales and with the candidate order Rice Cluster I. After several attempts at isolating the methanogens, we successfully isolated a methanogen affiliated with Rice Cluster I, and obtained a highly purified culture mainly consisting of a methanogen belonging to the family ‘Methanolineaceae’. These results indicate that anaerobic syntrophic substrate-degrading coculture system could be used as an effective method of isolating uncultivated methanogens.
- 社団法人 日本水環境学会の論文
- 2006-07-10
著者
-
大橋 晶良
広島大学大学院工学研究科社会環境システム専攻
-
原田 秀樹
東北大学大学院工学研究科土木工学専攻
-
鎌形 洋一
産総研ゲノム
-
酒井 早苗
JAMSTEC
-
酒井 早苗
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
井町 寛之
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
関口 勇地
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
大橋 晶良
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
原田 秀樹
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
鎌形 洋一
長岡技術科学大学 環境・建設系
-
原田 秀樹
東北大学大学院工学研究科
-
井町 寛之
海洋研究開発機構
-
井町 寛之
長岡技術科学大学大学院環境・建設系
-
関口 勇地
産総研
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