タンパク質の中性子解析における精密化手順
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
The protocol of refinement in neutron protein crystallographic analysis is described in this article. During the refinement, there are several features specialized for neutron experiment:(1) the mixed chemical structure of deuterium and hydrogen atoms, (2) solvent molecules around the protein, and the deuterium exchange in the polypeptide chain. We demonstrate the example of neutron refinement steps, using rubredoxin mutant, of which neutron diffraction collected using BIX-3 diffractometer at JRR-3 in Japan Atomic Energy Agency. The X-ray refinement program of CNS was used for the present refinement. Scattering lengths, stereochemical parameters, and command input files were modified for neutron experiment. These files would be the templates for the neutron protein crystallographic analysis.
- 日本中性子科学会の論文
著者
関連論文
- 哺乳類タンパク複合体に見られるサブユニット交換と立体構造の特徴(シンポジウム「立体構造からみたタンパク質の進化」)
- サイエンス記事 中性子小角散乱で見るタンパク質の異常凝集
- 放射線によるたんぱく質の構造変化及び機能変化の解析 (京都大学原子炉実験所第42回学術講演会報文集) -- (放射線による蛋白質の構造と機能変化の解析及び修復酵素の探索)
- X線解析によるプロテア-ゼの構造研究 (プロテオリシス--蛋白質分解の分子機構とバイオロジ-) -- (蛋白質分解系の新しい研究法)
- 2P006 ヒトヘモグロビンの中性子回折による構造研究(蛋白質 A) 構造)
- 1SH1015 構造生物学における中性子結晶解析(1SH Neutrons in Biologyの新たな夜明け〜大強度陽子加速器による中性子生物物理学の新展開〜,第48回日本生物物理学会年会)
- 3SA4-03 デオキシヘモグロビンの中性子結晶構造解析(3SA4 ヘモグロビンはいま,第47回日本生物物理学会年会)
- S2-2 哺乳類タンパク複合体に見られるサプユニット交換と立体構造の特徴(立体構造からみたタンパク質の進化,シンポジウム2,第34回学術講演会講演要旨集)
- 水溶液中タンパク質の小角散乱シミュレーション (京都大学原子炉実験所第42回学術講演会報文集)
- 中性子解析による蛋白質の水素・水和構造の精密化 (第41回京都大学原子炉実験所学術講演会 報文集)
- 小角散乱法によるPA28の会合形態の解析 (第41回京都大学原子炉実験所学術講演会 報文集)
- 生体分子の水素・水和構造と中性子結晶解析 (第41回京都大学原子炉実験所学術講演会 報文集)
- 入門講座「タンパク質結晶構造解析入門-ブラックボックスの中身-」を始めるにあたって
- シンクロトロン放射光によるタンパク質のX線構造解析
- 2P085 顕微分光で観測した高分子量チトクロム分子のX線照射による還元反応(ヘム蛋白質)
- 中性子科学への招待 : 中性子入門
- 放射光・中性子の構造生物学への展開--相補的利用をめざして
- 実験室系単結晶X線構造解析における二次元検出器利用のかんどころ(4) : 蛋白質結晶学における二次元検出器の利用
- 1P13 サリチル酸水酸化酵素のX線結晶構造解析
- 牛肝臓プロテアソーム活性化因子PA28の溶液中における分子様態
- 1P07 プロテアソーム活性化因子PA28の精製と結晶化
- 4.ビタミンB_補酵素関与グリセロールデヒドラターゼの結晶構造解析(第392回ビタミンB研究委員会研究発表要旨)
- 4.基質による触媒ラジカル生成の引き金機構:基質フリー型ジオールデヒドラターゼのX線結晶構造解析(第391回ビタミンB研究委員会研究発表要旨)
- ビタミンB_12補酵素関与グリセロールデヒドラターゼの結晶構造解析
- 11. タンパク質はいかにしてビタミンB_12補酵素から触媒ラジカルを生成させ,基質と立体特異的に反応させるか : ジオールデヒドラターゼの立体構造と反応機構
- 2C1615 硫酸還元菌由来高分子量チトクロムcのX線結晶構造解析
- 2C1600 大腸菌トリプトファン合成酵素βサブユニットの結晶構造解析
- 5. ジオールデヒドラターゼ立体構造 : ビタミンB_の新しい結合様式と一価陽イオンの酵素触媒への直接関与 (B群ビタミン酵素 : 立体構造からのファンクションを観る)
- 2PA066 大腸菌トリプトファン合成酵素βサブユニットの精製および結晶化
- 2PA065 ラット肝臓由来ミトコンドリア膜輸送促進因子(MSF)の分子充填と高分解能回折
- 3. ビタミンB_補酵素関与ジオールデヒドラターゼのX線結晶構造解析
- FMN結合タンパク質の高分解能X線回折データによる構造精密化
- ジオールデヒドラターゼーシアノコバラミン複合体の結晶構造解析
- 放射光・中性子結晶解析によるタンパク質の構造機能研究 (特集 量子ビーム利用研究の最前線)
- 量子ビームが切り拓く未来(III) : 中性子利用研究の新展開
- J-PARCにおける中性子の産業利用 (特集 量子ビームの新地平)
- ミトコンドリア膜輸送促進因子の回折実験とシグナルペプチド複合体の調製
- 3P03 ラット由来ミトコンドリア膜輸送促進因子の結晶化
- 2P01 FMN結合タンパク質の結晶学的研究
- 1P04 ビタミンB_を補酵素とするジオールデヒドラーゼの構造
- タンパク質構造解析のモデルビルディングのためのグラフィックスプログラムの開発 (サイエンティフィック・ヴィジュアライゼーション)
- 3P07 遺伝子操作による一本鎖DNA結合蛋白質の重原子誘導体調製
- 1P10 Rhodopseudomonas palustris由来モノマー型チトクロム c(prime)の立体構造
- 1P01 トリプトファン合成酵素αサブユニットの立体構造
- 大阪・熊取の「研究用原子炉」
- タンパク質の中性子解析における精密化手順
- 生体試料解析のための重水素化手法の確立 : KURDshop構築にむけて (京都大学原子炉実験所第46回学術講演会報文集)
- 地球ウイルスの構造と機能
- 放射光・中性子結晶解析によるタンパク質の構造機能研究 (特集 量子ビーム利用研究の最前線)
- タンパク質の中性子解析における精密化手順
- サイエンス記事 中性子小角散乱で見るタンパク質の異常凝集
- Book Review