RNA干渉の被食者捕食者モデルによる動態解析

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概要

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• RNA干渉(RNAi)の動態を表現する数理モデルとして、分子機構に基づいた微分方程式系がいくつか提案されている。これらはRNAiに関わる各要素について立式しているためパラメータ数が多く、また実際の観測が不可能である変数を複数含んでおり、モデルを同定するためのデータの取得は容易ではない。我々はRNAiの作用が被食者/捕食者系として捉えられることに着目し、ロトカ・ヴォルテラ型の競争モデルが十分にRNAiの動態を表現できることを、HeLa細胞のアポトーシス系の観測のモデリングにより確認した。これにより、直接には観測できないsiRNAの効果の強さを表すことができる。

• 2012-03-21

著者

• 吉川 智啓

  サイトパスファインダー

• 上田 尚学

  株式会社サイトパスファインダー

• 吉川 智啓

  株式会社サイトパスファインダー

• 富永 大介

  独立行政法人産業技術総合研究所

• 荒木 紀子

  株式会社サイトパスファインダー

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