9D-05 細胞シミュレーション統合プラットフォームの開発 : 顕微鏡画像に対するシミュレーションプリシステム(OS-6 バイオシミュレーションに向けたイメージベースドモデリングの新展開(1))
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
我々は細胞シミュレーション統合プラットフォーム(RICS)を開発中である.RICSは細胞内の生化学反応,物質拡散,膜機能の連成シミュレーションシステムで,次世代スパコン「京」を用いて細胞内の様々な現象のメカニズムを詳細に理解する事を目指している.RICSは入力データを作成するプリシステム,計算を行うソルバで構成される.本発表で紹介する新しいプリシステムは,球や円筒等の基本形状だけでなく,実細胞の顕微鏡観察画像から直接作成した形状に対しても,解析条件を設定することができる.これにより基本形状を用いた模擬細胞に加え,リアルな細胞形状でのシミュレーションを可能にし,細胞のメカニズム分析が可能である.
- 2011-01-07
著者
-
横田 秀夫
理化学研究所VCADシステム研究プログラム 生物基盤構築チーム
-
横田 秀夫
理研
-
野田 茂穂
理研
-
横田 秀夫
独立行政法人理化学研究所
-
横田 秀夫
独立行政法人理化学研究所 生体力学シミュレーション研究チーム
-
須永 泰弘
理研
-
吉澤 信
理研
-
横田 秀夫
理化学研究所
-
川島 康弘
富土通長野システムエンジニアリング広域ソリューション事業部
-
横田 秀夫
独立行政法人理化学研究所生体力学シミュレーション特別研究ユニット
-
吉澤 信
独立行政法人理化学研究所
-
野田 茂穂
RIKEN
-
横田 秀夫
独立行政法人 理化学研究所
-
川島 康弘
富士通長野se
-
横田 秀夫
独立行政法人理化学研究所基幹研究所
-
小山 隆司
理研:富士通長野se
-
須永 泰弘
RIKEN
-
吉澤 信
RIKEN
-
牧平 信志
FUJITSU NAGANO SYSTEMS ENGINEERING
関連論文
- 柔軟物体のためのアニメーションデザイン手法
- 530 有限要素法とCT osteoabsorptiometryを用いた股関節の応力分布の検討(OS4-2:関節のバイオメカニクス(2),OS4:関節のバイオメカニクス)
- 生体内部の発現遺伝子の3次元局在の観察手法の開発
- 粉末積層造形法を用いた人工骨成形法の提案 : 成形骨の多孔質性
- 粉末積層造形法を用いた人工骨成形法の提案 : 成形性の検討
- 試料内部3次元情報取得システムによるアルミニウム合金ダイカスト内部の鋳巣観察
- 逐次精密切削加工による試料内部3次元情報取得システムの開発
- APP-122-PM 腎癌患者の腹腔鏡手術を予行演習する : リハーサル型腹腔鏡手術シミュレータの開発(総会賞応募ポスター,第97回日本泌尿器科学会総会)
- 経路ベース木構造による主幹・側幹分岐型動脈の三次元構造の表現(画像認識,コンピュータビジョン)
- ケージド培養基板へのマイクロパターン形成手法の確立
- マイクロCTを用いたラット細気管支の局所コンプライアンスの評価 (〔平成16年度 日本バイオレオロジー学会研究〕奨励賞受賞者紹介および受賞論文)
- マイクロCTによる細気管支形状計測
- 2421 マイクロ CT によるラット細気管支の形態評価
- 測定データからの力学シミュレーション(計測データを基にした力学解析へ向かって)
- 新細胞内画像処理のすすめ
- J0102-2-3 Euler型解法FEMにおける固体-固体インターフェースを用いた接触問題の高精度化(次世代生命体統合シミュレーション(2))
- 動脈グラフの閉路の真偽判定法(生体工学)
- 多重蛍光の定量的分析のための独立成分分析による線形性評価に関する研究(生体工学)
- 331 実形状末梢気道内の気流シミュレーション(OS6-5:生体モデリングとシミュレーション(5),OS6:生体モデリングとシミュレーション)
- 109 Euler型解法FEMを用いた軟組織穿刺時の摩擦力に対する組織の静水圧の影響の検討(OS6-2:生体モデリングとシミュレーション(2),OS6:生体モデリングとシミュレーション)
- 822 Euler型解法FEMを用いた針穿刺における針と軟組織の変形シミュレーション(J05-1 生命体統合シミュレーション(1),ジョイントセッション,21世紀地球環境革命の機械工学:人・マイクロナノ・エネルギー・環境)
- Euler 型解法FEMによる針穿刺シミュレーションと穿刺実験の反力の比較
- 医療現場での計算工学適用の現状と展望
- 生体力学シミュレーションのための人体モデル構築
- 423 精密切削を利用した骨組織の3次元微視構造観察とミネラル分布測定(OS6-3:硬組織のバイオメカニクス(3),OS6:硬組織のバイオメカニクス)
- 525 イメージベース解析を用いた中敷の設計(OS2-7:生体モデリングとシミュレーション(7),OS2:生体モデリングとシミュレーション)
- B2 ジャンプ時におけるアキレス腱組織のひずみと応力の推定(生体1)
- 輪郭線編集による三次元抽出領域の修正インタフェース
- J0102-1-1 トランスポーター機能を組み込んだ細胞統合シミュレーションプラットフォーム(次世代生命体統合シミュレーション(1))
- 308 細胞シミュレーション統合プラットフォームの開発(OS11-2:マイクロ・ナノバイオメカニクス(2),OS11:マイクロ・ナノバイオメカニクス)
- 614 超弾性を考慮した生体組織の物性値データベース構築(OS2-6:生体モデリングとシミュレーション(6),OS2:生体モデリングとシミュレーション)
- 615 Eular型解法FEMを用いた針穿刺における針先シミュレーション(OS2-6:生体モデリングとシミュレーション(6),OS2:生体モデリングとシミュレーション)
- Eular 型解法FEMによる針穿刺シミュレーションの開発
- 2302 全身ボクセルデータ作成の高度化と臓器全身力学モデルの構築へのアプローチ(OS23.生命体統合シミュレーション(1))
- 0945 In vivo人体筋からの生理・力学情報の非侵襲計測(S05-3 生体のシミュレーション・モデリング・計測(3),S05 生体のシミュレーション・モデリング・計測)
- 1028 MR画像を用いた生体力学計測への静電モータの応用(G02-3 バイオエンジニアリング(3),G02 バイオエンジニアリング)
- 0929 Inverse FEMによる生体軟組織の異方性物性値同定(S05-1 生体のシミュレーション・モデリング・計測(1),S05 生体のシミュレーション・モデリング・計測)
- 501 統合力学シミュレーションのためのヒューマンモデル構築(OS8-1:デジタルヒューマン,オーガナイズドセッション8:デジタルヒューマン)
- 423 シンクロトロン放射光を用いたin vivo-CTの開発(OS3-2:肺・気道のメカニクス,オーガナイズドセッション3:肺・気道のメカニクス)
- 308 循環器全身血管系モデルの構築と大動脈多分岐モデルの血行力学シミュレーション(OS2-2:循環系のバイオメカニクス,オーガナイズドセッション2:循環系のバイオメカニクス)
- 心筋細胞を最小単位としてマウス心臓全体を対象とした高精細3次元構造観察
- 755 循環器全身動脈・静脈血管系のマルチスケール計算力学モデルの構築(J03-2 生体のミクロ-マクロをつなぐマルチフィジックス解析(2),J03 生体のミクロ-マクロをつなぐマルチフィジックス解析)
- 523 VCADシステムによるテーラーメイドインプラント製作システム(S11-2 イメージベースドモデリングの展開(2),S11 イメージベースドモデリングの展開)
- マルチスケール力学シミュレータを目指す循環器全身血管系モデルの構築
- 208 ラピッドプロトタイピングによる人工骨の成形(OS1-2 再生医工学(2),オーガナイズドセッション1:細胞・組織・器官のバイオメカニクス/再生医工学,学術講演)
- 頻度に応じたカラーヒストグラムの拡張による生体組織領域抽出
- 3. 生体力学シミュレーションのためのボクセル人体モデルの開発(医療のためのディジタルヒューマン技術)
- 生体形状データベース構築(生体研究におけるモデル化と応用)
- 322 粉末積層法による人工骨の成形(OS6:ラピッド・プロトタイピング,学術講演)
- 生体フルカラー連続断面画像からの組織抽出法の検討 : ウマ卵巣内構造物の可視化
- B207 脳動脈のネットワーク構造における血流シミュレーション(B2-2 生体流体工学1)
- 3次元内部構造顕微鏡とスーパコンピューターを用いたマウス全身の3次元高精細観察
- 1202 VCATによる個体別モデリング(S12-1 個体別モデリング(1),S12 個体別モデリング)
- A-1-14 OLDAによる生体連続断面画像からの関心組織の自動抽出(A-1.回路とシステム,基礎・境界)
- ラット誘発脳動脈瘤の発生と血流の寄与
- 枝ベースの木構造による血管形状の数値化の試み
- 3次元内部構造顕微鏡を用いたマウス3次元データベース作成の試み
- 生物形状の数値化の試み : 理研:生体形状情報の数値化及びデータベース構築研究での取り組み(生物の形をどう捉えるか)
- 3次元内部構造顕微鏡を用いた生体軟組織の半自動FEM解析メッシュ生成
- 527 ラット誘発脳動脈瘤内の流れの瘤発生への寄与(GS-14 : 動脈瘤)
- ボクセルエディタを用いた生物内部の3次元構造解析
- 逆畳み込み演算による3D-ISMフルカラー連続断面画像からの下層透過成分除去の試み
- 血管の3次元形状の数値化に向けた閉路検出による特徴量抽出の試み
- 3次元内部構造顕微鏡を用いた生体の微細血管構造観察
- ウマ卵巣内における卵胞配置の可視化の試み : 奇蹄目に特異的な卵巣構造の解明
- 3次元内部構造顕微鏡を用いたマウス系統のよる3次元構造の違いの観察
- 生物形状の数値化の試み : 理化学研究所で開始した生体形状情報の数値化及びデータベース構築研究
- ラット細気管支の局所コンプライアンスの評価
- 脳動脈瘤発生における血管壁組織構造の変化と血流の関係
- 227 眼球組織の力学的特性の測定 : 第 2 報強膜、水晶体嚢の測定
- 111 3 次元内部構造顕微鏡と共焦点レーザー顕微鏡 (LSM) を用いた微細血管構造観察法の検討
- フルカラー生体連続断面画像からの自動組織抽出法の検討 : 統計的手法を用いたウマ卵巣からの卵胞自動抽出の試み(領域抽出及び関連技術)(関連学会との共催によるバイオメディカルイメージング連合フォーラム)
- マウス体内における標的遺伝子の三次元発現パターン解析手法の開発
- 414 皮質骨リモデリング in vivo 実験モデルの基礎的検討
- 535 実形状モデル内の流れによる脳動脈瘤発生の検討
- 413 植物果皮におけるはじけるメカニズムの力学的検討 : 実験的検討(GS-04 : 生物の運動(1))
- 639 生体軟組織の実形状を反映した精密 FEM メッシュ作成法
- 125 マウス体内における発現遺伝子の 3 次元局在の観察
- 124 眼球の詳細な力学的特性の測定
- 3次元内部構造顕微鏡による生体の侵襲的イメージング
- 共焦点レーザー顕微鏡組込型3次元内部構造顕微鏡の開発と生体内3次元微細構造の観察 : 腎糸球体血管の観察
- 生体フルカラー連続断面画像からの関心組織領域の自動抽出法 : 第一報 : 関心領域の四段階選別
- 533 植物果皮のはじけるメカニズムの力学的検討 : 異方性の影響(計算バイオメカニクス3,OS25 計算バイオメカニクス)
- 0415 鼻腔内気流のボクセルシミュレーション(OS3-1:肺・気道のバイオエンジニアリング1)
- S0203-1-2 鼻腔内気流の数値シミュレーション(上部気道の輸送現象)
- 運動関数を用いた昆虫3次元形状モデルによる運動シミュレーション
- 高速Bilateralガウス変換(理論・方法)
- 307 細胞シミュレーションに向けたモデル構築のための生細胞観察法(OS11-2:マイクロ・ナノバイオメカニクス(2),OS11:マイクロ・ナノバイオメカニクス)
- リン酸塩を焼結阻害剤に用いたバイオイメージング用イットリアナノ粒子の作製と評価
- 気道末梢部位のイメージングと気流シミュレーション
- 研究室紹介および研究紹介
- F03-(3) フルカラー生体断面画像からの 6 面体メッシュ作成法
- 放物面ミラーの超精密ELID研削
- 細胞運動に伴うアクチンダイナミクスに関する研究
- 生体力学シミュレーションに向けた人体モデルの構築
- 注目技術 超微粒子バインダレスcBN切削工具とその加工技術
- 各種眼科疾患におけるシミュレーション
- 312 生体の色情報を用いた有限要素メッシュ作成法(OS11-2 骨格系のモデリングと解析)(OS11 計算バイオメカニクス : バイオエンジニアリング部門との合同企画)
- 255 3 次元内部構造顕微鏡を用いた生体の 3 次元ディジタイジング : 第 2 報 : 軟組織のクラシフィケーション
- 三次元内部構造顕微鏡による豚眼球三次元モデルの構築