タンパク質の新規サブドメインの提案-二次構造、モジュールを超える新たな構造単位の定義に向けて-
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概要
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本稿では、タンパク質の階層性を解明することを目的とし、独立したパーツとして利用可能で、ドメインより細かい階層の新たな構造単位を提案する。従来、ドメインより細かい構造単位として 「空間的コンパクトさ」 を指標とする、モジュールが提唱されてきた。しかし、空間的コンパクトさはパーツの独立性とは直接関係ない。独立したパーツとして利用可能なパーツを探すためには、独立性と直接関係した量を指標にしなくてはならない。そこで、本研究ではポテンシャルエネルギーを指標として用い、タンパク質のサブドメインを定義し、いくつかのタンパク質で新しいサブドメインの発見を試みた。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2009-05-18
著者
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