植物転写因子のゲノム情報解析
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概要
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We analyzed transcription factors (TFs) of plant Arabidopsis thaliana by genome informatics and investigated them in caparison with our previous study on human TFs. We focused on 557 transcription factors from Arabidopsis thaliana, which were annotated with experimental evidence in the Swiss-Prot database. Consulting the GTOP database, structural domains and intrinsically disordered regions were assigned and located along the sequence for individual TFs, which were then grouped into TF families depending on the DNA binding domain they possessed. The results have shown that the average length of plant TFs is shorter than that of human TFs, while the ratio of disordered regions to the mil length is commonly high (40%-50%) in both cases. This suggests that a high fraction of intrinsically disordered regions in TFs, contrary to prokaryotic TFs, is one of common characteristics throughout eukaryotes.
- 前橋工科大学の論文
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