Linkage between Light Microscopic Observations and Molecular Analysis by Single-Cell PCR for Ciliates
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概要
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The molecular analysis of ciliates for identification and phylogeny is usually conducted through PCR amplification and DNA sequencing, with DNA extracted from a large number of cells. Therefore, the analysis of ciliates is limited to only those species that can be cultured. We propose a single-cell PCR procedure to overcome the difficulty in the analysis of unculturable species. The procedure has been tested on 6 Stichotrichia strains and uncultured Levicoleps biwae cells, targeting 18S rRNA gene sequences, after carrying out microscopic observations and obtaining photographic records. This procedure enables the systematic analysis of unculturable ciliate strains in natural environments by linking the morphology and genotype of a single cell.
- 日本微生物生態学会の論文
著者
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笠原 康裕
北大低温研
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Kasahara Yasuhiro
College Of Agriculture Ibaraki University : Institute Of Low Temperature Science Hokkaido University
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Kasahara Yasuhiro
Inst. Of Low Temp. Sci. Hokkaido Univ.
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Kasahara Yasuhiro
Institute Of Genetic Ecology Tohoku University
-
Shimano Satoshi
Environment Education Center Miyagi University Of Education
-
Shimano Satoshi
National Agricultural Research Center For Tohoku Region:(present Office)environmental Education Cent
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SANBE MITSUO
Environment Education Center, Miyagi University of Education
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Sanbe Mitsuo
Environment Education Center Miyagi University Of Education
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笠原 康裕
北海道大・低温研
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Shimano Satoshi
Environmental Education Center, Miyagi University of Education
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