Angular Momentum Form of Verlet Algorithm for Rigid Molecules(General)
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概要
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A new simple algorithm is presented for solving the equations of motion for rigid molecules. These equations are integrated using a Verlet framework in the angular momentum form. This simple algorithm is named "the angular momentum Verlet algorithm". For obtaining a high accuracy in molecular dynamics (MD) simulations, we introduce the scaling method with the constraint by Lagrange's method of undetermined multipliers. The results of MD simulations for carbon tetrachloride using the angular momentum Verlet algorithm are reported. The relative total energy fluctuations for carbon tetrachloride using the angular momentum Verlet algorithm are compared with those using the standard leap-frog and Gear predictor-corrector algorithms. The energy drift using the angular momentum Verlet algorithm is smaller than that using the leap-frog or Gear predictor-corrector algorithm, particularly for large time intervals. The MD simulations for AX_nY_<4-n>-type models having different moments of inertia are also carried out to investigate the effects of the angular momentum Verlet algorithm for molecules with different symmetries. We found that the time integrations for the model with the largest moment of inertia are stable. The scaling method with the constraint by Lagrange's method of undetermined multipliers in the angular momentum Verlet algorithm is effective in obtaining a smaller energy drift, particularly for large time intervals.
- 社団法人日本物理学会の論文
- 2008-06-15
著者
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樋山 みやび
分子科学研究所
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樋山 みやび
総研大
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樋山 みやび
慶大理工
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Hyodo Shi-aki
Crest Japan Science And Technology Agency:toyota Central R&d Labs. Inc
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Kinjo Tomoyuki
Toyota Central R&d Labs. Inc
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HIYAMA Miyabi
CREST, Japan Science and Technology Agency
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Hiyama Miyabi
Crest Japan Science And Technology Agency:toyota Central R&d Labs. Inc
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