農業用水路中のストレプトマイシン耐性菌の探索と単離菌のグルーピングへのMALDI-TOF MSの適用
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概要
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佐賀県の10ヶ所のクリークから採取した表層水を10μg/mlストレプトマイシンを含むR2A培地に接種して,ストレプトマイシン耐性菌の探索を行った.16S rRNA遺伝子解析により,ストレプトマイシン耐性を持つ菌はBacillus,Novosphigomium,Sphingopyxis,Oceanobacillus属に高い相同性を有することが明らかになった.また単離菌の60%がカップ法において700μg/mlのストレプトマイシン溶液を投与しても阻止円を形成しなかった.ここで得られた単離菌に対して,マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析装置(MALDI-TOF MS)による分類の有効性を検討した.その結果,MALDI-TOF MSは16S rDNAの1,000bpに対してAlu I,Hae III,HhaIを作用させたRFLP(restriction fragment length polymorphism)より高い識別能を示した.MALDI-TOF MSは,そのハイスループットな能力を考慮すると,MALDI-TOFマススペクトルデータベースの構築によって迅速な微生物の同定手段になる可能性を持つと思われる.
- 2008-03-01
著者
-
嵐谷 奎一
産業医科大学
-
佐藤 浩昭
独立行政法人産業技術総合研究所環境管理技術研究部門
-
市来 弥生
福岡工業大学大学院生物有機化学研究室
-
青木 智宏
福岡工業大学大学院生物有機化学研究室
-
高島 泰斗
福岡工業大学大学院生物有機化学研究室
-
田村 廣人
名城大学農学部生物環境科学科環境微生物学研究室
-
寺本 華奈江
独立行政法人産業技術総合研究所環境管理研究部門
-
吉川 博道
福岡工業大学大学院生物有機化学研究室
-
田村 廣人
名城大農
-
嵐谷 奎一
産業医科大学産業保健学部第2環境管理学講座
-
寺本 華奈江
独立行政法人産業技術総合研究所環境管理技術研究部門
-
田村 廣人
名城大学農学部
-
吉川 博道
福岡工大
-
市来 弥生
福岡工業大学大学院物質生産システム工学専攻
-
佐藤 浩昭
産業技術総合研 環境管理技術研究部門
-
吉川 博道
九州共立大 ・ 環化
-
佐藤 浩昭
独立行政法人産業技術総合研究所
-
吉川 博道
福岡工業大学大学院機能材料工学専攻
-
吉川 博道
九州共立大学大学院工学研究科環境システム学専攻:(現)福岡工業大学
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