結合編集ソフトウエアShotgunの評価
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
ゲノムプロジェクトにおいて、DNAシークエンサーから読まれてくる数多くのDNA断片を、それらの間の重複部分配列を利用して、ゲノムの塩基配列を再構成する結合編集システムは重要な役割を果たしている。ここでは、Shotgun(塩基配列フラグメントデータの結合編集システム)の評価方法とこの結果について報告する。この方法では43kbのフラグメントをランダムで500個の350bから450bまでのフラグメントに切り出して、そして、それらのデータをShotgunにかけ、結果を評価する。この評価によって、Shotgunシステムがヒトゲノム配列を高い精度で再構成できることが示されている。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1995-02-07
著者
-
村上 康文
理研・細胞生理
-
村上 康文
理化学研究所 細胞生理
-
菅原 秀明
理化学研究所ライフサイエンス研究情報室
-
浴 俊彦
理研・細胞生理
-
浴 俊彦
理化学研究所細胞生理学研究室
-
王 忠清
理化学研究所ライフサイエンス研究情報室
関連論文
- クロマチン関連遺伝子の変異が出芽酵母第VI染色体全遺伝子の転写に及ぼす影響
- ヒト第21番染色体ダウン症領域1.6Mbのシークエンシング
- B-6 WDCMにおけるWWWサーバの構築(マルチメディア環境)
- B-4 蛋白質抗原sequencial epitopeの特徴とPIR(専門分野知識)
- WDCMにおけるWWWサーバの構築
- B-1 酵母の分類と同定(専門分野からの接近(1))
- 平成11年度日本分子生物学会年会
- ゲノム創薬とは何か(創薬を支える新技術)
- 染色体複製開始領域を含むヒトDNA断片の単離
- 出芽酵母ゲノム解析で見いだされた新規ヘリカーゼ様遺伝子の機能解析
- 出芽酵母第VI染色体上の新規増殖必須遺伝子の機能解析
- 出芽酵母ゲノム解析で見いだされた新規ヘリカーゼ様遺伝子の機能解析
- 新規遺伝子Egeの同定とその機能
- 蛍光物質および退色防止剤のin vitro SV40複製系に与える影響
- 心筋症ハムスターの原因候補遺伝子サルコグリカンの解析
- ヒトDNAプライマーゼサブユニット遺伝子の構造解析
- 結合編集ソフトウエアShotgunの評価
- SV40,ポリオ-マウイルスのin vitro DNA合成 (動物細胞のDNA複製に関与する酵素とその遺伝子-2-)
- 出芽酵母ゲノム解析の現状と展望 -----ゲノム解析からプロテオーム解析へ
- インターネットと科学技術情報
- 5. 培養生物に関するデータバンク : ワールドデータセンターとハイブリドーマデータバンク(セミナー「動物・植物の細胞・遺伝子の保存」)
- 第11回真核細胞DNAシンポジウム/癌遺伝子産物とDNA合成(学会見聞記)
- 出芽酵母ゲノムの全塩基配列決定の意義
- ヒト21番染色体に由来するYACクロ-ンとそのSTS〔英文〕(短報)
- 理化学研究所における実験生物情報システムNISLOの開発