薬物分子の三次元構造類似性にもとづくデータマイニング
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概要
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化学物質の種々の性質はその化学構造と密接に関連していることは良く知られている事実である.筆者らはこれまでに,グラフ論的なアプローチにもとづく三次元共通構造特徴の自動認識システムCOMPASS (COMmon geometric Pattern Search System)の開発を進めてきた.本研究ではこれを基礎とし,与えられたデータセットに対する三次元構造類似性検索への応用を試みた.ここでは,クエリー分子とデータセット中の各分子の三次元構造をCOMPASSを用いて比較し,探索された共通部分構造のサイズ(ここでは構成原子(団)の数)をこれらの間の類似性の尺度と定義した.治験医薬品データベースMDDR-3Dから抽出したテストデータベースを対象に,ドーパミンD2アンタゴニスト活性を持つ分子をクエリーとした類似構造検索の結果,同様の活性を持つ化合物が上位にランクされ,本法の有用性を強く示唆する結果を得た.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2003-03-13
著者
-
加藤 博明
豊橋技術科学大学 知識情報工学系
-
高橋 由雅
豊橋技術科学大学知識情報工学系
-
高橋 由雅
豊橋技術科学大学
-
阿部 英次
豊橋技術科学大学 知識情報工学系
-
高橋 由雅
豊橋技術科学大学工学部知識情報工学系
-
阿部 英次
豊橋技術科学大学
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