1L1730 構造情報に基づく蛋白質・DNA認識特異性の定量化とターゲット予測への応用

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 日本生物物理学会の論文
• 2000-08-05

著者

• 皿井 明倫

  理研・筑波LS

• 河野 秀俊

  ペンシルバニア大

• Selvaraj Samuel

  理研・筑波研

• 河野 秀俊

  原子力機構

• Prabakaran Ponraj

  理研・筑波研

関連論文

• 1R14 原がん遺伝子産物c-MybとDNAとの複合体の動的構造
• 原がん遺伝子産物c-MybとDNAとの複合体の動的構造
• 1A1015 DNA結合タンパク質c-Mybの熱力学的安定性解析 : キャティでの非炭素原子を含む側鎖置換の効果
• 1P136 DNA塩基と蛋白質アミノ酸の相互作用自由エネルギーランドスケープ(核酸,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P103蛋白質・DNA認識におけるアミノ酸・塩基相互作用の特異性 : 長鎖アミノ酸及び芳香族アミノ酸
• 1L1330 核酸塩基・アミノ酸相互作用の自由エネルギーランドスケープ : 蛋白質によるDNA認識における特異性
• 3PA122 転写因子のターゲット予測 : Structure-based法とab-initio法
• 2P034蛋白質・リガンド相互作用データベース、ProLINT、の開発と応用
• 2S1-4 熱力学データと構造データの統合化(2S1 動き出したライフサイエンス統合データベース,第46回日本生物物理学会年会)
• 22aWB-6 DNAの構造ゆらぎと水和パターンの関係(22aWB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 3P130 DNAの柔らかさの塩基配列依存性と水和の関係(細胞生物学的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)、水・水和、電解質,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P016 未構造タンパク質の機能と進化的特性の解析(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P015 ストラクチュロームでの分子ネットワークの構築と解析(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P257 DNA結合蛋白質における保存されたアミノ酸のネットワーク : ホットスポットの類似と予測への応用(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P256 機械学習によるDNA結合サイトの予測 : 方法の改良とベンチマーク(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P230 ORI-GENEを用いた必須遺伝子の進化系統解析(生命情報科学(比較ゲノミクス・分子進化),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P138 出芽酵母ゲノムの転写制御ネットワークの解析(核酸,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P131 蛋白質・DNA認識におけるDNAバックボーンコンフォメーションの役割(蛋白質(蛋白質工学・進化工学)、核酸結合蛋白質、核酸,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P001 酵母ゲノムでのDNA結合蛋白質の予測(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• S04H2 生体分子間相互作用の熱力学データベースと解析(立体構造から生体分子間相互作用の熱力学へ,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)
• タンパク質のDNA認識メカニズムと予測
• 2P145 Molecular Dynamics Simulations of DNA : Application to the Specificity of Protein-DNA Recognition
• 2P144 蛋白質・DNA認識における協同性の分子メカニズム(核酸 B) 相互作用・複合体))
• 2P143 蛋白質-DNA認識における直接認識と間接認識の寄与バランス(核酸 B) 相互作用・複合体))
• 2P134 分子動力学によるDNA構造の配列依存的特性の解析(核酸 A) 構造・物性))
• 3P068 Latest developments in ProTherm : Thermodynamic Database for Proteins and Mutants
• 2P119 Indirect readout in protein-DNA recognition : evaluation of conformational energy of DNA from molecular dynamics simulations
• 24pTG-2 X線自由電子レーザーによる生体分子単粒子構造解析法の理論的研究(24pTG 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 2P110 分子動力学によるDNAの配列依存的構造特性の解析(核酸 A) 構造・物性)
• 蛋白質・DNA複合体のQSAR解析
• 1P066 単分子X線回折像からの立体構造構築法の開発(蛋白質(計測解析の方法論),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P104Update of ProNIT : Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions
• 3P001ProTherm(蛋白質と変異体の熱力学データベース)の最近の進展と応用
• 1L1715 蛋白質-核酸相互作用の熱力学データベース
• 1A1145 蛋白質とその変異体の熱力学データベース : ProTherm第2版
• 3E1100 蛋白質・リガンド相互作用データベースの構築
• 1J1000 Real value prediction of accessible surface area in proteins
• 1M1445 蛋白質・DNA認識の特異性と酵母ゲノムレベルでの転写因子のターゲット予測(5.核酸(A)構造・物性(B)相互作用・複合体,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 2P118 Latest Developments in ProNIT : Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions
• 2P117 タンパク質-核酸複合体形成の熱力学量と立体構造(核酸 B) 相互作用・複合体)
• Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions(ProNIT) : Recent Developments
• ProNIT : タンパク質-核酸相互作用データベース(ゲノム・プロテオーム検索と解析のネットサイト)
• 1M1500 タンパク質-核酸相互作用の熱力学データベース(ProNIT)の進展と熱力学・構造の関係への応用(5.核酸(A)構造・物性(B)相互作用・複合体,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1I1045 Recent developments in ProTherm : Thermodynamic Database for Proteins and Mutants
• 2A1600 蛋白質表面の変異による安定性変化の予測におけるRamachandran plot上の変異位置の重要性
• 3PA120 蛋白質・核酸相互作用データベース(Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions)
• 3PA079 蛋白質とその変異体の熱力学データベース : ProTherm
• 2P103 転写因子とターゲット予測システムの構築(核酸結合蛋白質)
• コンビナトリアルタンパク質設計
• 2PA052 3DinSight : An Integrated Database and Visualization Tool of Bio-information
• 1M1515 Binding Free Energy Changes for the interaction of SYCRP1 with DNA by Systematic Base Pair Substitution
• 3K1100 Comparison of Evolutionary and Computational Profiles of Proteins
• 3P101蛋白質によるDNA配列の直接認識と間接認識
• 1M1430 Two Maximum Step-Size Monte-Carlo Simulation of DNA-Protein Interactions
• 1L1730 構造情報に基づく蛋白質・DNA認識特異性の定量化とターゲット予測への応用
• レトロウイルスエンベロープ蛋白質の受容体結合特異性の変換
• 3P285 デイノコッカス・ラジオデュランスの放射線抵抗性に関与する遺伝子探索(生命情報科学 B) 機能ゲノミクス)
• 28aYE-8 転写システムに注目したゲノム機能予測(領域9,領域12合同シンポジウム : バイオクリスタリゼーション,構造ゲノム科学,バイオインフォマティクス : その3重点に出現する新phaseの発見)(領域9)
• 28aYE-8 転写システムに注目したゲノム機能予測(領域9,領域12合同シンポジウム : バイオクリスタリゼーション,構造ゲノム科学,バイオインフォマティクス〜その3重点に出現する新phaseの発見〜)
• 転写システムに注目したゲノム機能予測
• 1L1745 転写因子のターゲット予測のための統合ツール
• A Novel Hydrogen - Bonded Duplex Made up of Water Molecules and Halide Ions in the Sandwich Inclusion Structures of (C_H_8N_3S)^+・X・2H_2O[X=Cl^-,Br^-]
• A Novel Hydrogen-Bonded Duplex Made up of Water Molecules and Halide Ions in the Sandwich Inclusion Structures of(C_H_8N_3S)^+・X・2H_2O[X=Cl^-, Br^-]
• 3P099λ及びCroリプレッサーと核酸の特異的相互作用の解析
• 1L1700 蛋白質・DNA認識における塩基置換効果の予測(V)Croリプレッサーと核酸の特異的相互作用の解析

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク