X線結晶構造解析と分子動力学シミュレーションで紐解く膜輸送体の分子機構

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概要

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• Membrane transporters transport their substrates across the membrane, thereby contributing to the maintenance of the cellular environments. One of the largest superfamily of the membrane transporters is Major Facilitator Superfamily (MFS), and many of MFS transporters are involved in the cellular uptake of various compounds utilizing the proton motive force across the membrane. Although several crystal structures of MFS transporters have been reported so far, their active transport mechanism has still remained elusive. Proton-dependent oligopeptide transporter, POT, is a member of MFS, and is involved in the uptake of oligopeptides as well as peptide-like drugs. In this article, we explain the active transporter mechanism by POT based on our recent results of the structural and computational analyses.

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日本生物物理学会 | 論文

• 2SD3 トランスジェニック発現系を用いたマウス嗅覚受容体遺伝子の解析
• 分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門 : 生物情報解析の理論とアルゴリズム, 共立出版, J. C. Setubal and J. Meidanis(著), 五條堀孝(監訳), 遠藤俊徳(代表訳), B5判, 286ページ, 本体5,300円, 2001年12月
• 3P079 分子動力学シミュレーションによるPhoB DNA結合タンパクのダイナミクス解析(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• S12A3 転写関連因子の動的構造と天然変性状態(蛋白質の再発見によるゲノムから細胞に至る生物の統一的理解,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P026 水溶液環境下でのディスタンスジオメトリ法によるタンパク質の構造決定 : simulated annealingによる構造精密化(蛋白質 A) 構造))

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