病原細菌と共生細菌のIII型分泌装置のエフェクタータンパク質を区別する特徴は何か?
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概要
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近年、細菌がホスト細胞に送り込むエフェクタータンパク質が、病原細菌と共生細菌の双方に存在することが注目されているが、その差異は未だ明らかでない。本研究では、両者の差異を司る物理化学的特徴セットをカーネルロジスティック回帰の情報量基準によって抽出し、その判別性能を SVM によって評価し、さらにその相互依存関係及び最も特徴的な領域を、グラフィカルモデリングと sliding window 解析によって明らかにした。
- 2010-06-11
著者
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柳川 堯
久留米大学 医学部 バイオ統計センター
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柳川 堯
久留米大学バイオ統計センター
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矢原 耕史
久留米大学医学研究科バイオ統計学群
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姜 英
久留米大学医学研究科バイオ統計学群
-
柳川 堯
久留米大学 バイオ統計センター
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