オリゴヌクレオチド組成を用いた一括学習型自己組織化地図法によるA型インフルエンザウイルスの俯瞰的な特徴解明
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概要
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A 型インフルエンザウイルスの全ゲノム配列を対象に,オリゴヌクレオチド組成を基にゲノム配列の俯瞰的な特徴把握が可能な BLSOM 解析を行った.宿主・セグメント・サブタイプを反映して分離 (自己組織化) しており,これらの分離に寄与している特徴的なオリゴヌクレオチド頻度を知ることができ,宿主や亜型の特徴,感染性や毒性などに関連した特徴,時系列的な変化を効率的に把握することが可能となった.
- 2009-09-10
著者
-
伊藤 正恵
長浜バイオ大学
-
池村 淑道
長浜バイオ大学・生命情報科学
-
阿部 貴志
長浜バイオ大学・生命情報科学
-
阿部 貴志
長浜バイオ大学
-
岩崎 裕貴
長浜バイオ大学
-
池村 淑道
長浜バイオ大学
-
伊藤 正恵
長浜バイオ大 バイオサイエンス
-
阿部 貴志
新潟大学
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