プロテオーム解析のための陰イオン交換クロマトグラフ法の開発と超好熱古細菌Aeropyrum pernix K1の膜タンパク質検出への応用(<特集>生命科学と分析化学)

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概要

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全ゲノム塩基配列が決定した微生物の網羅的なプロテオーム解析を目指し,陰イオン交換クロマトグラフ法を用いたタンパク質の分離・精製方法を開発した.プロテオーム解析では,前処理段階で膜タンパク質が不溶化し,検出が困難になることが問題とされている.著者らは,陰イオン交換体を充填したガラスカラムに直接細胞破砕物を導入し,溶解性のタンパク質を溶出させた後,残留している難溶解性の膜タンパク質をカラム内で酵素消化し,溶出させる方法を開発した.この方法を超好熱古細菌であるAeropyrum pernix K1のプロテオーム解析に応用し,溶出物を,高速液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析法により,タンパク質の同定を行った.その結果,新たに10種類の膜タンパク質を検出・同定することができた.よって,本法は,今まで他の方法では検出することが困難であった難溶性の膜タンパク質を検出するのに有効な方法であると考えられる.
2006-12-05

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