タンパク質フォールディングにおけるシャペロニンの閉じ込め効果と強制アンフォールディング : 分子動力学シミュレーション

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 日本生物物理学会の論文
• 2003-08-25

著者

• 高田 彰二

  京都大学理学研究科生物科学専攻生物物理学教室

• 高田 彰二

  科技団さきがけ:神戸大・理・化学

• 高城 史子

  科技団さきがけ

関連論文

• アロステリーの分子機構 : MWCかあるいはKNFか? : 理論モデル計算によるアプローチ
• 2S4-4 結合による構造変化と生体分子システムの作動原理(2S4 タンパク質の構造に秘められた動作原理を読み取る,第46回日本生物物理学会年会)
• 3P279 タンパク質モジュールシャッフリングによる新規フォールド出現の可能性 : 計算機実験(蛋白質(蛋白質工学/進化工学),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P074 粗視化モデルによるタンパク質の構造変化とリガンド結合の共役メカニズムの解明 : 分子モーターへの応用(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P145 分子動力学シミュレーションによるモータータンパク質KIF1Aの運動機構の解析(分子モーター,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P107 タンパク質フォールディングのエネルギー地形とネットワーク : マルチカノニカル・フラグメントアセンブリシミュレーション(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• S09A4 分子シミュレーションによるF1-ATPase回転機構の研究(F_1-ATPase分子モーターの機構- 一分子計測/構造生物学/分子シミュレーションのクロストーク-,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)
• 21pRK-5 Wang-Landau samplingに基づくタンパク質のフォールディングエネルギー地形の解析(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 3P171 ミオシンの運動機構の解明に向けて : 粗視化モデルによる分子シミュレーション(分子モーター))
• 3P004 タンパク質の高精度モデリングに向けて : 全原子モデルによるフラグメントアセンブリ法(蛋白質 A) 構造))
• 3P002 フラグメントアセンブリ法による膜蛋白質の立体構造予測(蛋白質 A) 構造))
• 2P173 モーター蛋白質F1-ATPaseの運動様式変換機構 : 分子動力学シミュレーション(分子モーター))
• 1P108 ATP依存でのタンパク質のアンフォールド・トランスロケーション : ミニマルモデルシミュレーションによるそのメカニズムの理解(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など)))
• 1P099 タンパク質は側鎖を伸ばしてリガンドを掴む : カルモジュリンループのCa^結合における分子動力学シミュレーション(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など)))
• 1P062 タンパク質の構造変化のメカニズムを探る : Multiple GO Modelによる分子動力学シミュレーション(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
• 1SD01 Multiple funnels for protein dynamical function
• 対話的動作を考慮したタンパク質立体構造予測システム(グリッドアプリケーション)
• タンパク質立体構造予測の現状と未来
• CASP6会議報告 : 日本勢がんばる(談話室)
• 実数値 GA によるタンパク質立体構造の 2 層比較(バイオインフォマティクス)(情報システム論文)
• タンパク質のネガティブデザイン : 新規アルゴリズム
• 31aPS-87 タンパク質フォールディングにおけるダイナミックス解析 : 非定常性・非マルコフ性ヘリックス・シート構造の相関
• 1I1700 生体内タンパク質超分子複合体の理論模型(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3P069巨大分子混み合いの密度汎函数理論 : 細胞内でのタンパク質の理解に向けて
• 郷モデルの35年 : 郷信広先生に応えて
• 水と生体分子が織りなす生命現象(3)タンパク質のフォールディングシミュレーションから立体構造予測問題に迫る
• 1P074 ATPに依存的な蛋白質のアンフォールディングとトランスロケーション : ミニマルモデルによるシミュレーション(蛋白質 D) 機能 : 反応機構、生物活性など)
• 亜鉛結合タンパク質の分子進化シミュレーション : 機能向上に誘起される折れ畳み能力の進化
• 3P097 タンパク質構造トポロジー形成における局所安定構造の役割 : 分子動力学シミュレーション(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 3P095 Multiple GO Modelによるタンパク質の大規模な構造変化の解析(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 3P067 ROKKY : 蛋白質立体構造予測の統合サーバー(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 回転モータータンパク質F1-ATPaseの分子機構 : 折れたたみモデルを応用した分子動力学シミュレーション
• 2O1630 モーター蛋白質F1-ATPaseの回転を生み出す分子機構の解析 : 分子動力学シミュレーション(11.分子モーター,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3P052何がフォールディング機構を決めているか?構造トポロジーと配列
• 3P084 構造変化を伴なう多量体形成シミュレーション(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P151 異なるヌクレオチド状態における分子モータ-KIF1Aの構造揺らぎ(分子モーター,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 22aRK-2 異なるヌクレオチド状態における分子モーターKinesinの構造揺らぎ(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 2P201 ミオシンモータードメインの構造変化とヌクレオチド解離シミュレーション(分子モーター))
• 27aPS-95 ミオシンモータードメインの構造変化とヌクレオチド解離シミュレーション(領域11,領域12合同ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 3P133 ミオシンモータードメインの構造緩和シミュレーション(分子モーター)
• 3P070 タンパク質のde novo立体構造予測 : CASP6における成功と失敗(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 3P069 立体構造予測からタンパク質立体構造構築原理を探る(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 2P042 フラグメントアセンブリ法によるタンパク質立体構造予測のための戦略的フラグメント探索(蛋白質 A) 構造)
• 2SD05 Protein structure predictions for new fold targets in CASP6
• フラグメントアセンブリ法におけるフラグメント長とエネルギーランドスケープ
• タンパク質のde novo立体構造予測 : ポテンシャル関数の最適化
• 1J1645 第一原理的蛋白質立体構造予測の為のリバーシブルフラグメントアセンブリ法(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3P118 全原子モデルを用いた新規タンパク質デザインシステムの開発と構造デザインへの応用(蛋白質 F) 蛋白質工学/進化工学)
• タンパク質フォールディングにおけるシャペロニンの閉じ込め効果と強制アンフォールディング : 分子動力学シミュレーション
• P22 巨大分子混みあいによる高分子のコンパクト化(基研研究会「ソフトマターの物理学」,研究会報告)
• 1I1715 細胞内におけるタンパク質の構造形成 : 分子動力学シミュレーション(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3P068タンパク質の構造形成と細胞内様"巨大分子混みあい" : 分子動力学シミュレーション
• 19aYF-2 タンパク質の構造形成と細胞内様"巨大分子混みあい" : 分子動力学シミュレーション
• 3P071 分子シャペロン環境を模したタンパク質構造探索法の研究 : de novo立体構造予測に向けて(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 2SC4 ゲノム配列からのタンパク質折りたたみ
• 3P053タンパク質の立体構造予測に向けて : 疎水性環境レプリカ交換法
• 3A1515 ファントム鎖モデルとレプリカ交換法を用いたタンパク質立体構造探索の高速化
• 1P055タンパク質のde novoデザイン-3 helix bundleの場合 : (II)構造物性の実験的検証
• 1P054タンパク質のde novoデザイン-3 helix bundleの場合 : (I)エネルギーランドスケープ理論による配列設計
• 2P041 フラグメント組合せ法を拡張した膜タンパク質の立体構造予測(蛋白質 A) 構造)
• 膜タンパク質の立体構造予測に向けて
• 2SP5-04 蛋白質の大振幅ゆらぎと機能の分子シミュレーション研究(2SP5 生体分子の揺らぎをはかる,第47回日本生物物理学会年会)
• 環境によって誘起される蛋白質の二次構造 : レプリカ交換法によるサンプリング
• S3A02粗視化モデルによる物理化学的アプローチ
• 1P073 カルモジュリンにおけるカルシウム結合反応 : タンパク質とカルシウムイオンの水和構造の変化(蛋白質 D) 機能 : 反応機構、生物活性など)
• 蛋白質フォールディングのファネル理論と動的機能 (特集 蛋白質フォールディングの諸問題)
• 分科会 タンパク質のfoldingの解析
• 1L1045 βタンパク質のde novo designに向けた理論解析(1.蛋白質(F)蛋白質工学/進化工学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3G1330 タンパク質の人工設計と折り畳み可能性
• 座談会 生物物理の未来 (300号記念特集 生物物理の未来)
• タンパク質のアロステリーと配列デザイン原理
• 生物物理の未来
• 1I1515 タンパク質のde novo立体構造予測 : 全原子モデルの構築(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1I1545 タンパク質立体構造構築における局所構造の役割 : データベース解析と構造予測(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3P054粗視化モデルによるタンパク質の立体構造予測 : Z-scoreに基づくエネルギー関数の最適化
• 1C1130 タンパク質の立体構造予測 : 進化論的情報と物理化学的モデル
• Short Review 蛋白質の立体構造トポロジーとフォールディング
• 酒と大物教授と谷口国際シンポジウム - 第24回谷口国際シンポジウムに参加して -
• タンパク質の構造空間 : ファネルとエネルギーランドスケープ(1999年度後期基礎物理学研究所研究会「蛋白質-配列空間と構造空間におけるダイナミクス-」)
• タンパク質フォールディングの物理化学 : ファネルとフォールディング経路
• 1SF05 粗視化モデルによるフォーディングシミュレーション : 立体構造予測へ向けて (タンパク質のフォールディング問題 : 立体構造予測から分子病理まで)
• 28a-S-4 タンパク質のフォールディング : 理論からのアプローチ

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク