システムトキシコロジープラットフォーム
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概要
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システムバイオロジー的アプローチで毒性学を推進することに対する期待が高まっている。 環境中や食品中に存在する毒性物質のみならず，医薬品の副作用に関してもシステム的な理解が必須である。本講演では，我々が米国食品医薬品局(U.S. Food and Drug Administration: FDA)と行っている抗がん剤における心毒性と肝毒性の計算機予測のプロジェクトならびにそこで利用されているソフトウエアプラットフォームに関して紹介する。本プロジェクトでは，我々が提唱して推進しているGaruda Platformが採用され，CellDesignerやPhysioDesignerなどの一連のソフトウエアが有機的に連動して利用されている。これらのソフトウエア群を利用して，詳細な心筋細胞ならびに肝細胞の分子間相互作用マップを構築して，これを基盤に実験データの解析，モデルの精緻化，ネットワーク解析，動的シミュレーションなどの手法を組み合わせることで，抗がん剤の副作用の理解と計算機予測を行う。関連論文：Ghosh, S.; Matsuoka, Y.; Asai, Y.; Hsin, KY.; Kitano, H. Software for systems biology: from tools to integrated platforms. Nature Reviews Genetics, 12(12), 821-832, Dec. 2011.Kitano, H. A robustness-based approach to systems-oriented drug design. Nature Reviews Drug Discovery, 6(3), 202-210, March 2007.
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