X線溶液散乱と分子動力学シミュレーションで探るタンパク質の構造揺らぎ
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概要
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The combination of small-angle X-ray solution scattering (SAXS) experiments and molecular dynamics (MD) simulations is now becoming a powerful tool to study protein dynamics in solution at an atomic resolution. We have developed a method called MD-SAXS, in which this combination is used with explicit evaluation of X-ray scattering from water molecules hydrating protein molecules. This method offers a link between low-resolution structural information from SAXS and the three-dimensional high-resolution structure. The study using MD-SAXS method revealed the importance of intrinsic dynamics of DNA-binding protein EcoO109I in its function.
著者
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佐藤 衛
横浜市立大・総合理学研究所
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池口 満徳
横浜市立大学
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苙口 友隆
慶應義塾大学 理工学部物理学科
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苙口 友隆
慶應義塾大学理工学部 物理学科
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池口 満徳
横浜市立大学大学院生命医科学研究科生命医科学専攻
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