地図情報を用いた植物収集地点検索システムとその活用法
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概要
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植物遺伝資源の収集地点をWeb上の地図に表示し特性評価と気候情報により検索するための植物収集地点検索システムを開発した.本システムの検索機能のため収集地点データベースを構築し,気候データと特性評価データによる検索画面を作成した.本システムは,選択した遺伝資源に対して来歴,特性評価に関する情報の表示,およびユーザが有する収集地点データを地図上に表示する機能を提供する.また,特性評価データと位置情報との相関を推定するための評価指数を定義した.さらに,DNA多型解析を行って地図上に多型分布をプロットさせるため, Vigna(ササゲ)属関連SSRマーカー情報の提供用Webページを作成した.本システムを利用することにより,生物分野の研究者は,植物遺伝資源の生息地とその周辺環境を視覚的に理解できるようになった.その結果,生育に適した環境の推定や収集候補地の選定などを効率的に行えるようになり,植物遺伝資源研究の進展への貢献が期待できる.
著者
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竹谷 勝
独立行政法人農業生物資源研究所遺伝資源センター
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山崎 福容
独立行政法人農業生物資源研究所 基盤研究領域 ジーンバンク
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友岡 憲彦
独立行政法人農業生物資源研究所 基盤研究領域 ジーンバンク
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竹谷 勝
独立行政法人農業生物資源研究所 基盤研究領域 ジーンバンク