PepNovo と PEAKS を用いた de novo ペプチド配列解析

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概要

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• We present a technique of de novo peptide sequencing from MALDI TOF/TOF tandem mass spectra by web-based programs, PepNovo and PEAKS. Furthermore, we show the result of de novo peptide sequencing of kidney bean granule-bound starch synthase I (GBSSI).マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型タンデム質量分析計 (MALDI TOF/TOF MS) によって得られた MS/MS スペクトルを用いて, de novo ペプチド配列決定する手法を解説する。ウェブベースのソフトウェアである PepNovo と PEAKS online を使用した解析方法を紹介する。また, インゲンマメ Granule-bound starch synthase I (GBSSI) を試料とした解析例を示す。

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