56(P-29) 抗腫瘍性抗生物質C-1027の三次元構造(ポスター発表の部)
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
C-1027 is a potent antitumor antibiotic, in which a nonprotein chromophore is tightly and specifically bound to an apoprotein. The chromophore, which has an endiyne structure and is responsible for DNA cleavage, is very labile when isolated, but greatly stabilized through binding to the apoprotein. Their binding structure and stabilizing interactions are very interesting problems in terms of molecular recognition and protein transport. The 3D structure of C-1027 apoprotein was determined by the X-PLOR calculation using 1539 experimental restrains derived from NMR spectroscopy. The apoprotein has three antiparallel β-sheets, and the hydrophobic pocket is formed by four-stranded β-sheet (DCHI) and two loops (residues 75-79, 97-100)(Fig.3). The overall shape of the apoprotein is quite similar to those of neocarzinostatin (NCS) and actinoxanthin (AXN). The binding structure of C-1027 complex was calculated based on 1539 NMR-derived constraints which include 38 intermolecular restraints between the aromatized chromophore and the apoprotein. The aromatized chromophore is bound to the hydrophobic pocket of the apoprotein. The benzodihydropentalene core locates in the center of the pocket with its molecular plane almost perpendicular to the bottom of the pocket. The β-tyrosine unit locates on the left side of the core, and both benzoxazine and aminosugar moieties on the right side (Fig.4). The hydrophobic interaction is most likely the major binding interaction between the apoprotein and the aromatized chromophore. Moreover, the 18-amino group of the chromophore locates in the proximity of either the carboxylate of Asp101 or the imidazole ring of His104, which indicates there could be a salt-bridge or a hydrogen bond type interaction between the aromatized chromophore and these side chains. To confirm the predicted binding interactions, we made several mutant apoproteins whose specific amino acid residue is replaced with the amino acid of different type and examined their binding abilities for the aromatized chromophore by NMR. The results obtained will be discussed.
- 天然有機化合物討論会の論文
- 2000-10-01
著者
-
田中 俊之
筑波大応生
-
大谷 敏夫
大鵬薬品化学療法剤研
-
福田 純子
東北大院理:crest
-
平間 正博
東北大院理
-
石塚 みどり
筑波大応生 TARAセ
-
大谷 敏夫
大鵬薬品
-
平間 正博
東北大学大学院理学研究科
関連論文
- 18 ケダルシジンクロモフォアアグリコン保護体の合成(口頭発表の部)
- 33 新規抗腫瘍性抗生物質C-1027のクロモフォアの構造(口頭発表の部)
- 9 ネオカルジノスタチン複合体の三次構造 : 分子認識とクロモフォア安定化機構(口頭発表の部)
- 77 新Mosher法による直線形海洋天然物のコンフォメーション解析(ポスター発表の部)
- 17 巨大ペプチド系天然物ポリセオナミドBの全合成(口頭発表の部)
- 65 アミジグサ科褐藻の生産する新ジテルペン
- 5 褐藻サナダグサに含まれる新奇ジテルペンの構造
- 32 新規テロメラーゼ阻害物質telomestatinに関する研究(口頭発表の部)
- 40 シガトキシンの全合成と構造活性相関(口頭発表の部)
- 34(D-4) メリラクトンAの全合成(口頭発表の部)
- 44(P-3) 超天然物の設計と創製 : 抗腫瘍性抗生物質C-1027の合理的改変による安定化(ポスター発表の部)
- 56(P-29) 抗腫瘍性抗生物質C-1027の三次元構造(ポスター発表の部)
- 39 クロモプロテイン系エンジイン抗生物質の化学 : 常磁性を示す原理(口頭発表の部)
- P-35 C-1027クロモフォアの全合成研究(ポスター発表の部)
- 2P047 抗シガトキシン抗体10C9 Fab-シガトキシン間相互作用の構造学的・熱力学的解析(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 30 シガトキシン特異的抗体の調製とサンドイッチイムノアッセイ(口頭発表の部)
- 43 シガトキシンCTX3Cの全合成(口頭発表の部)
- 7 シガトキシンの全合成研究(口頭発表の部)
- 118(P60) シガトキシン絶対配置決定と抗体調製への合成化学的アプローチ(ポスター発表の部)
- 28 マデュロペプチンクロモフォアアグリコンの全合成(口頭発表の部)
- メリラクトンAの全合成 : 遠隔不斉誘導と不斉非対称化
- 4 O,S-アセタールを基盤としたシガトキシン類統一的全合成(口頭発表の部)
- 16 TMC-95Aの全合成(口頭発表の部)
- 16 有毒アオコMicrocystis viridisから単離した新奇三環性デプシペプチドMicroviridinの構造(口頭発表の部)
- Recognition of Helicity by Native Cyclodextrins.Highly Enantioselective Complexation of Tetrahelicene Dicarboxylic Acid with β-Cyclodextrin
- Chiral Recognition of Tetrahelicene Dicarboxylic Acid by Linear Dextrins
- 42 ネオカルジノスタチンクロモフォアおよび10員環アナログの合成研究(口頭発表の部)
- 9員環エンジイン抗生物質N1999-A2の全合成 : 絶対配置とDNA切断
- 96(P-40) ピンナトキシンAの全合成研究(ポスター発表の部)
- フェノールの直接オルトビニル化反応
- 59 CD vs NMR : 新Mosher法を用いた海洋性テルペンの絶対配置の決定(ポスター発表の部)
- P-36 タンパク-クロモフォア複合型抗生物質C-1027の合成研究(ポスター発表の部)
- 25 アミジグサ科海藻からの白アリ分泌物質様ジテルペン(口頭発表の部)
- PB38 SYNTHETIC STUDIES TOWARD AVERMECTIN B1a AND MILBEMYCIN α1
- A simple desymmetrization approach to the spiroxin framework
- A Novel Route to 1,8-Dihydroxynaphthalene-derived Natural Products. Synthesis of (±)-CJ-12,372
- 11 抗腫瘍性抗生物質ケダルシジンクロモフォアの構造訂正と全合成研究(口頭発表の部)
- Alkynyldichlorogalliums are Unstable in Hydrocarbon Solvents Dimerization of Alkynyldichlorofalliums via Carbogallation
- Structure of Adduct Formed from α-Trichlorostannyl Ketone and Trichloroethynyltin a Direct Evidence for the Carbostannylation of Alkynyl Metals
- Direct Formation of Reactive Alkynyltrichlorotins from 1-Alkynes SnCl_4, and Bu_3N. A Mild Alkynylation Reagent of Aldehydes, Acetals, and Enones
- 高反応性エンジイン系抗腫瘍性物質の機能と合成
- 35 褐藻サナダグサ中の新ジテルペンの構造
- 毒素 CTX3C の化学合成から予防へ : 世界最大規模の海産物食中毒シガテラ
- シガトキシン全合成への道のり
- Synthetic Study of C-1027 Chromophore. Highly Stereoselective Glycosylation
- Synthetic Study of C - 1027 Chromophore: Enantioselective Synthesis of β - Tyrosine Moiety and Effective Aryl Ether Formation
- Direct Observation of ESR Spectra of Bicyclic Nine-Membered Enediynes at Ambient Temperature
- 閉環メタセシス反応の新たなる展開--不斉触媒化 (1999年の化学(6))
- 地の利, 人の和, そして始めに天然物ありき
- シガトキシン類の全合成を中心とした生理活性天然物の化学的研究
- フグ毒よりコワ∿イ食中毒シガテラ : 毒素の化学合成から予防へ
- ビラジカルを発生する超天然物(最近の天然物化学の進歩)
- 有機合成から自然原理の発見へ
- エンジイン化合物の合成--K.I.君の物語 (生物活性天然物の合成--複雑な構造をいかにして構築するか) -- (天然物の合成)
- 35 (-)-マデュロペプチンクロモフォアの全合成と構造改訂(口頭発表の部)
- P-29 コルチスタチンAおよびJの全合成(ポスター発表の部)