Remarkable Solvent Effects on Depletion Interaction in Crowding Media : Analyses Using the Integral Equation Theories(Cross-disciplinary physics and related areas of science and technology)
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
In theoretical studies on the depletion interaction between macromolecules in crowding media, usually only the macromolecules and large cosolutes are considered by assuming that the solvent can be treated as an inert background. Here, the interaction between macromolecules immersed in a solvent-cosolute mixture is calculated using the integral equation theories combined with a hard-sphere model. On the basis of the results, we point out the crucial importance of explicit incorporation of solvent molecules in the theoretical treatment. The behavior observed is highly nonlinear due to the complicated intermolecular correlations and remarkably dependent on the total packing fraction and the cosolute concentration. An example result is that the cosolute can act both as a stabilizer and as a destabilizer for a dimer of macromolecules. We present new physical pictures elucidating the behavior.
- 社団法人日本物理学会の論文
- 2006-06-15
著者
-
Kinoshita Masahiro
Institute of Advanced Energy, Kyoto University
-
Kinoshita Masahiro
Institute Of Advanced Energy Kyoto University
-
KARINO Yasuhito
Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyushu University
-
AKIYAMA Ryo
Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyushu University
-
HAGIWARA Yasuhiro
Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyushu University
-
Akiyama Ryo
Department Of Chemistry Graduate School Of Science Kyushu University
-
Akiyama Ryo
Department Of Applied Chemistry Faculty Of Science Science University Of Tokyo(sut) And Crest Japan
-
Karino Yasuhito
Department Of Chemistry Graduate School Of Science Kyushu University
-
Kinoshita Masahiro
Institude Of Advanced Energy Kyoto Univ.
-
Hagiwara Yasuhiro
Department Of Chemistry Graduate School Of Science Kyushu University
関連論文
- 1P-079 水のエントロピーに注目したタンパク質の熱安定性解析(蛋白質・物性(1),第46回日本生物物理学会年会)
- 2P-038 リガンド-タンパク質問の結合自由エネルギーに対するマルチフィジクス的計算手法の比較および評価(蛋白質・構造機能相関(2),第46回日本生物物理学会年会)
- 3P-115 溶質近傍のハイパーモバイル水に関する理論解析(水・水和/電解質,第46回日本生物物理学会年会)
- Three-Dimensional Density Profiles of Small and Medium Spheres near a Pair of Large Spheres : Relevance to Entropic Interaction Induced between Large Spheres
- Remarkable Solvent Effects on Depletion Interaction in Crowding Media : Analyses Using the Integral Equation Theories(Cross-disciplinary physics and related areas of science and technology)
- 29pYB-10 Remarkable concentration effect on interaction between two large solutes immersed in a binary solvent
- 3P077 Refinement of Modeled Protein Structure by Replica Exchange Molecular Dynamics and Hydration Entropy based Scoring Function(Protein: Property,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)
- 2P-055 水のエントロピーに焦点を置いたタンパク質-リガンド間結合能の新規計算手法(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第47回日本生物物理学会年会)
- 1P062 蛋白質-蛋白質複合体のホットスポットの理論的予測(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第48回日本生物物理学会年会)
- 1P073 蛋白質立体構造予測に向けた自由エネルギー関数の開発(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第48回日本生物物理学会年会)
- 1P-047 蛋白質の二次構造形成における側鎖のパッキングの役割(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第47回日本生物物理学会年会)
- 1P-048 蛋白質熱安定性における水のエントロピー効果(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第47回日本生物物理学会年会)
- 1P111 中温性及び好熱性シトクロームcの熱安定性に及ぼすヘムの効果 : 実験結果と理論解析結果の比較(ヘム蛋白質,第48回日本生物物理学会年会)
- 1P-046 アラニンベースペプチドのヘリックスーコイル転移に及ぼす圧力効果 : 統計力学理論解析(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第47回日本生物物理学会年会)
- Potential of Mean Force between Solute Atoms in Salt Solution : Effects Due to Salt Species and Relevance to Conformational Transition of Biomolecules
- 2P414 The Integral Equation Studies on Interaction between Charged Colloidal Particles(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)
- 1P-127 フィラメント近傍で形成されるリニア-モータータンパク質のエントロピックポテンシャル場 : 単純化モデル計算I(分子モーター,第47回日本生物物理学会年会)
- 1P-045 蛋白質の低温変性構造に関する理論解析(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第47回日本生物物理学会年会)
- 1P049 溶媒和効果を利用した溶質の取り込みと放出 : シャペロニンGroELに関する研究(蛋白質-物性(安定性,折れたたみなど),第48回日本生物物理学会年会)
- Lanthanide Triflate-Catalyzed Three-Component Coupling Reactions of Aldehydes, Hydroxylamines, and Alkenes Leading to Isoxazolidine Derivatives
- 1H1436 蛋白質-蛋白質複合体のホットスポットにおける水のエントロピー効果の重要性(蛋白質_物性 2,第49回日本生物物理学会年会)
- 2B1424 分子サイズの溶質分子による水の分極の分子動力学シミュレーション(水・水和/電解質,第49回日本生物物理学会年会)
- 1L1536 イーストF1-ATPaseの16°回転に伴う水のエントロピー変化の理論解析(分子モーター1,第49回日本生物物理学会年会)
- A scoring function based on solvation thermodynamics for protein structure prediction
- 1PT154 水及び非水環境におけるタンパク質の立体構造安定性(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))
- Effects of Barbiturates on Blood Pressure in Lidocaine Hydrochloride Injected SHR
- 3P109 X線結晶構造の決定に向けた膜タンパク質構造安定性の理論的向上(03.膜蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))