大量ゲノムデータの解析速度を基準としたグリッドコンピューティングの有効性の検証(セッション1 : 分散コンピューティング)
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概要
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グリッドコンピューティングは、そのシステム上、疎結合型並列処理向きである。一方、生命情報学分野では解析に多重配列整列が用いられる事が多く、小規模演算が大量に繰り返される事から、グリッドコンピューティングに適していると考えられる。そこで、グリッドコンピューティング上で多重配列整列処理を行い、データ量やデータ数、スペック等を変更した場合の処理速度を計測した。その結果をスタンドアロンPC上での処理速度と比較し、有効性の検証をおこなったのでここに報告する。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2004-01-29
著者
-
田中 博
東京医科歯科大学 情報医科学センター
-
五味 悠一郎
東京医科歯科大学難治疾患研究所情報医学部門 生命情報学
-
荻島 創一
東京医科歯科大学難治疾患研究所生命情報学
-
五味 悠一郎
豊橋創造大学
-
田中 博
東京医科歯科・難治疾患・生命情報:東京医科歯科・疾患生命科学・生命情報
-
荻島 創一
東京医科歯科大院・生命情報
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