A Fractal Model of Protein Conformations and Spectral Exponents for the Densities of Low-Frequency Normal Modes of Vibration
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概要
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Spectral exponents m defined in the power law relationship p(v)c( v" ' between thedensity of vibrational states p(v) and the frequency v at very low frequencies arecalculated by means of the normal mode analysis of molecular mechanics for nineglobular proteins. For the sake of comparison, fractal dimensions d are also esti-mated from the backbone conformations of the same set of proteins. The resultsshow that m and d range from 1.53 to 1.77 and from 1.49 to 1.85, respectively, andwell agree with the fractal model of protein conformations proposed by Stapleton etal. (Phys. Rev. Lctt. 45 (1980) 1456), in which it is asserted that m is equal to d and dis close to the theoretical value 5 / 3 associated with a self-avoiding random walk.[fractal dimension, spectral exponent, normal mode analysis, molecular ]l mechanics, protein conformation, protein dynamicsl
- 社団法人日本物理学会の論文
- 1989-06-15
著者
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Wako Hiroshi
School of Social Sciences, Waseda University
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Wako Hiroshi
School Of Social Sciences Waseda University
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Wako Hiroshi
School Of Social Sci. Waseda Univ.
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