Spectral Analysis of Amino Acid Sequence.I.Intrinsic Membrane Proteins
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概要
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rrimar>' structure of r>roteins occasionallv shows r>eriodic pattern of h>'dro-rhobicit>'. The reriodicitv in the h>zdror>hobicitv of amino acid sequence wasstudied for intrinsic membrane proteins. Power spectral density was calculated bya maximum entropy method which shows the hinhest resolution or spectra fromshort sequences of data amon: various methods. Power srectral densit>' from totalamino acid sequence gave a sharp peak at the period of 40 residues, arising fromthe average distance between neighboring helices. Spectral analysis of everyfifteen residues indicated that the helix-reriodicit>' of 3.6 residues was significantlylocalized at the edges or helices. Functionally important helices had the tendencyto exhibit the heljx-period also at the center of the helix.
- 社団法人日本物理学会の論文
- 1984-11-15
著者
-
ABE TOSHIO
Department of Urology, Aichi Medical University School of Medicine
-
Mitaku Shigeki
Department of Applied Physics, Graduate School of Engineering, Nagoya University
-
Mitaku Shigeki
Department Of Applied Physics Faculty Of Engineering University Of Tokyo:(present Address) Departmen
-
Mitaku Shigeki
Dept. Of Appl. Phys. Grad Sch. Of Engi. Nagoya Univ.
-
Abe T
Okayama Univ. Okayama
-
HOSHI Satoru
Department of Material Systems Engineering,Faculty of Technology,Tokyo University of Agriculture and
-
KATAOKA Ryoichi
Department of Material Systems Engineering,Faculty of Technology,Tokyo University of Agriculture and
-
Hoshi Satoru
Department Of Material Systems Engineering Faculty Of Technology Tokyo University Of Agriculture And
-
Kataoka R
Tokyo Univ. Agriculture And Technology Tokyo Jpn
-
Kataoka Ryoichi
Department Of Material Systems Engineering Faculty Of Technology Tokyo University Of Agriculture And
-
Abe Toshio
Department Of Internal Medicine Kanazawa Municipal Hospital
-
Mitaku Shigeki
Department Of Applied Physics Faculty Of Engineering University Of Tokyo
-
Abe Toshio
Department Of Cardiovascular Surgery Japanese Red Cross Nagoya First Hospital
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